基于人工智能胜利挑选出身物钟相关功效基因 |
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姑苏年夜学剑桥-苏年夜基因组资本中间的研讨团队应用开辟的基于机械培训(卷积神经网络)辨认同步化参数的人工智能算法,设计了能体系化和自动化辨认小鼠运动及饮食日夜节律的挑选器。他们与来自国内上14个科研机构的团队单干,针对国内小鼠表型阐发同盟的家养型小鼠数据展开了生物钟相关功效基因高通量挑选研讨。
研讨团队通过对750个渐变小鼠品系的运动和饮食数据进行挑选,发现了5个能够影响小鼠日夜节律同步化的基因(Slc7a11, Rhbdl1, Spop, Oxtr, Ctc1)。随后对Slc7a11基因渐变小鼠进行了验证,发现Slc7a11缺失可招致小鼠运动与外界运动分歧步。分子程度的阐发显示,Slc7a11缺失小鼠体内介导下丘脑视穿插上核(SCN)神经元耦合的神经多肽表白产生了改动,从而招致内涵生物钟与外界光照情况失同步。这些挑选到的失同步化基因敲除小鼠,为相关生物钟与代谢运动研讨,提供了非焦点钟调控体系之外的根据。
该研讨树立了依托国内年夜迷信工程,联合人工智能算法,高通量挑选生物钟相关基因的研讨战略,为基于国内表型阐发同盟后续发生的年夜规模基因敲除小鼠数据挑选失同步化基因,以及深化懂得机体与情况的日夜节律若何同步化的成绩奠基了根底。同时该办法也能够用于判断人类生物节律的错乱人群。(100yiyao.com)
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