Nat Mach Intell：新型人工智能技术或能预测人类机体的抗癌免疫力

起源：本站原创 2021-09-29 11:23

来自德克萨斯年夜学东北医学中间等机构的迷信家们通过研讨开辟了一种人工智能技术，其或能辨认出被机体免疫体系所辨认的癌细胞外表的肽类，即新抗原。

2021年9月29日 讯 /100医药网BIOON/ --新抗原（neoantigens）在T细胞辨认肿瘤细胞上饰演着症结脚色，然而，仅有一小部门新抗原能真正惹起T细胞反馈，并且对于哪些新抗原能被哪些T细胞受体辨认到的线索也十分少；近日，一篇颁发在国内杂志Nature Machine Intelligence上题为“Deep learning-based prediction of the T cell receptor–antigen binding specificity”的研讨申报中，来自德克萨斯年夜学东北医学中间等机构的迷信家们通过研讨开辟了一种人工智能技术，其或能辨认出被机体免疫体系所辨认的癌细胞外表的肽类，即新抗原。

更多的示例提醒了TCRs能被自动编码器胜利嵌入。

图片起源：Lu, T., et al. Nat Mach Intell (2021). doi：10.1038/s42256-021-00383-2

这种名为pMTnet的新型人工智能技术或无望帮忙研讨者开辟新办法来预测癌症患者的医治预后以及对免疫疗法的潜在反馈。研讨者Tao Wang传授表现，确定哪些新抗原能与T细胞受体联合，哪些不克不及联合仿佛是一项不太能够实现的工作；但应用机械培训伎俩，咱们就能取得严重停顿。癌细胞中基因组的渐变会招致其外表展示出分歧的新抗原，此中一些新抗原就能被捕获癌症迹象和外来入侵者的免疫T细胞所辨认，从而就会匆匆进癌细胞被宿主机体免疫体系所毁坏，然而，其它新抗原仿佛对T细胞隐身了，从而就会匆匆进癌症受控成长。

关于免疫体系来讲，新抗原的存在是正常细胞和肿瘤细胞之间最年夜的区别之一，要是咱们能弄分明哪些新抗原能刺激机体的免疫反馈，随后就能以多种方式来应用这一常识从而对立癌症。可能预测哪些新抗原被T细胞所辨认可能帮忙迷信家们开辟个别化癌症疫苗，并设计更好的基于T细胞的疗法，或预测患者对其它免疫疗法的反馈水平，但无数以万计的分歧的新抗原，并且预测哪种新抗原能诱发T细胞反馈的办法也被证实比拟耗时，且在技术上具备一定的挑战性，本钱也较为昂扬。

图片起源：https://www.nature.com/articles/s42256-021-00383-2

这篇研讨申报中，研讨职员转而应用机械培训伎俩来进行研讨，他们应用来自三种组分已知联合或不联合的组合的数据：新抗原、次要组织相容性复合物（MHCs，次要存在于癌细胞外表出现的新抗原上）和担任辨认新抗原-MHC复合体的T细胞受体（TCRs），通过训练一种名为pMTnet的基于深度培训的算法；随后研讨职员应用从30项分歧的研讨中开辟的数据集来测试这种新型算法，这些研讨通过试验性的伎俩辨认出告终合或不联合的新抗原T细胞受体对，成果标明，这种新型算法具备很高的精确性。

研讨职员应用这种新型对象得到了对癌症基因组图谱（领有超过1.1万个原发性肿瘤相关信息的公共数据库）中新抗原的相关见解，pMTnet算法研讨成果显示，与肿瘤相关的抗原相比，新抗原通常会诱发更强的免疫反馈，同时其还能预测哪些患者对免疫查看点阻滞疗法有更好的反馈，以及能给患者带来更好的总体生活率。综上，本文研讨成果标明，应用pMTnet作为一种新型对象或能深化研讨并阐发人类肿瘤中T细胞受体和次要组织相容性复合物之间的亲密互相作用。（100医药网100yiyao.com）

原始出处：

Lu, T., Zhang, Z., Zhu, J. et al. . Nat Mach Intell (2021). doi：10.1038/s42256-021-00383-2

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