细胞基因组:新突破!或者乳腺癌可以分为12个独特的生物群! |
来源:原创网站2022-01-07 10:45
来自北卡罗来纳州立大学Lineberger综合癌症中心等机构的科学家在整合乳腺癌研究的两种关键方法上迈出了一大步,一种是通过基因分析,另一种是通过观察细胞结构或其病理表现;如今,由于联邦组织的癌症基因组图谱(TCGA)乳腺癌数据集的资源带来的十年努力,研究人员可以将这两种方法结合起来。科学家发现遗传学和病理学分类之间有许多不同。
2022年1月7日/100 bion/-乳腺癌可分为许多不同的组织学类型,但目前研究人员对许多罕见乳腺癌类型的特征描述有限。近日,在国际期刊《细胞基因组学》上发表的题为《TCGA乳腺癌组织学类型的分子分析》的研究报告中,来自北卡罗来纳州立大学Lineberger综合癌症中心等机构的科学家在整合两种研究乳腺癌的关键方法上向前迈出了一大步,一种是通过基因分析,另一种是通过观察细胞结构或其病理表现;如今,由于联邦组织的癌症基因组图谱(TCGA)乳腺癌数据集资源带来的十年努力,研究人员可以将这两种方法结合起来。科学家们发现了遗传学和病理分类之间的许多相似之处,因此他们开发了一种新的方法,可以利用这两个系统的数据,得出一种新的方法,将乳腺癌分为12个不同的生物群/组。
图片:维基媒体
研究员Charles Perou博士说,我们早就知道乳腺癌不是一种疾病。现在,通过多年的分子研究和几十年的病理学知识,我们已经开始将它们整合成一种语言。这可能会极大地促进科学家未来的研究,并使分子研究结果能够更快地转移到病理实验室用于临床。世卫组织长期以来根据肿瘤细胞的特殊形状、结构和大小将乳腺肿瘤分为多种类型。最常见的乳腺癌被定义为浸润性导管乳腺癌,占所有乳腺癌的70%-80%。虽然这种占主导地位的乳腺癌类型长期以来一直吸引着科学家的关注和研究,但最新的研究发现,罕见的乳腺癌类型往往能让研究人员做出新的研究发现。
TCGA 33种不同类型癌症的10,000多例病例可能使研究人员能够探索以前未知但罕见的乳腺病理特征;然而,对于科学家来说,获得足够的样本来全面研究罕见癌症类型和亚型可能是一个巨大的挑战,但是由研究员佩鲁领导的TCGA乳腺癌研究小组可以获得足够的样本,其中至少包含六种罕见乳腺癌类型,每种类型都可以产生非常特殊的分子特征。值得注意的是,罕见的化生癌是一种预后不良的乳腺癌亚型。通过比较TCGA 10000个肿瘤样本的差异,研究人员发现一些化生癌与黑色素瘤和肉瘤密切相关。
图片:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s2666979x2100835? via=ihub
研究员Aatish Thennavan博士指出,我们的努力已经完成了TCGA所有的规划分析,这是一项非常重要的工作。在这项研究中,我们使用了其他包含罕见癌症亚型的数据库来证实我们的研究结果,我们将继续进行深入研究,以纳入更多罕见类型的癌症,以便在此基础上进行更深入的研究。后来研究人员计划深入研究化生乳腺癌的分子特征和细胞起源。现在他们非常有兴趣研究为什么12个乳腺癌生物群中有一部分可以表现出免疫细胞浸润肿瘤细胞的特征,为什么其他生物群不能表现出免疫细胞的浸润。这一研究方向可能具有重要意义,因为研究人员有望开发针对乳腺癌免疫细胞的新疗法。
综上所述,本文的研究结果表明,根据综合基因组和组织学特征,他们将TCGA-BRCA划分为12个共识组,并提出了丰富且可公开获得的TCGA-BRCA基因组、分子和组织学特征资源,从而对各类型乳腺癌开展更深入的研究。(100yiyao.com 100医疗网)
原始来源:
Aatish Thennavan,Francisco Beca,Youli Xia,等,细胞基因组学(2021)。doi : 10.1016/j . xgen . 2021.100067
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