Adv Sci:王军/宋默识团队利用AI从肠道菌群中高效挖掘抗癌肽 |
来源:生物世界 2023-10-10 09:28
该研究表明,有39种ACPs对至少一种癌细胞系具有抑制作用。其中,效果最强的2个ACPs显著抑制小鼠结直肠癌皮下移植瘤的生长,且在100mg/kg体重的高剂量使用中没有表现出对小鼠的急毒性。近日,中国科学院微生物研究所王军研究团队和中国科学院动物研究所宋默识研究团队合作在Advanced Science期刊发表刘题为:Efficient Mining of Anticancer Peptides from Gut Metagenome的封面论文。
该研究利用抗菌肽(Antimicrobial peptides,AMPs)和抗癌肽(Anticancer peptides,ACPs)之间的重叠特征,结合成熟的AMP预测方法与宏基因组挖掘技术,有效地从肠道微生物组中挖掘新的抗癌肽。
该研究利用AMP和ACP之间大量的重叠特征,基于AMP预测方法,从1279条AMPs中成功识别出1033条ACPs,并通过对(Colorectal cancer,CRC)患者队列的宏基因组数据分析,鉴定出40种与癌症表型相关的ACPs。
该研究表明,有39种ACPs对至少一种系具有抑制作用。其中,效果最强的2个ACPs显著抑制小鼠结直肠癌皮下移植瘤的生长,且在100mg/kg体重的高剂量使用中没有表现出对小鼠的急毒性。因此,该研究利用新的方法再次发现了科利毒素(Coley s toxin),为肿瘤治疗提供了大量的新药物前体。
中国科学院微生物研究所博士研究生马越、硕士研究生刘小林、内蒙古科技大学包头师范学院联合培养学生张旋和博士研究生于莹为该论文的共同第一作者,中国科学院微生物研究所王军研究员和中国科学院动物研究所宋默识研究员为本文的共同通讯作者。该研究得到了国家重点研发计划、中国科学院战略性先导科技专项、北京市等项目的资助。
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