Dev Cell |
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山东大学刘峰团队(张一帆及康志鑫为论文的共同第一作者)在Developmental Cell在线发表题为 Single-cell omics identifies inflammatory signaling as a trans-differentiation trigger in mouse embryos 的研究论文,该研究利用单细胞组学鉴定炎症信号作为小鼠胚胎的转分化触发器。
为了探索转分化的潜在普遍原理,该研究在小鼠胚胎中进行了内皮到造血转化(EHT)、内皮到间充质转化和上皮到间充质转化的单细胞转录组分析。应用熵、细胞型特征转录因子表达和关键过渡信号三个评分指标来显示支持过渡状态命运可塑性的共同特征。
跨模型比较确定了炎症特征的过渡状态和白细胞介素-33在促进命运转换中的共同触发作用。多模式分析(整合转录组学和染色质可及性分析)证明了造血规范的炎症调节。此外,多模态组学和命运定位分析表明,内皮特异性Spi1作为炎症效应因子,控制着适当的染色质可及性和转录程序,以保护EHT。总的来说,该研究使用单细胞组学来识别关键的过渡状态/信号以及炎症信号在发育应激诱导的命运转换中的常见触发作用。
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