Cell：泛癌症蛋白质基因组学或有望揭示癌症治疗性靶点蓝图

来源：100医药网 2024-07-08 10:57

本研究者的目的是更好地理解已知药物靶点的特性，希望能识别出新的靶点从而帮助开发新型药物。

美国批准的癌症药物能靶向作用的蛋白质不足200种；近日，一篇发表在国际杂志Cell上题为 Pan-cancer proteogenomics expands the landscape of therapeutic targets 的研究报告中，来自贝勒医学院等机构的科学家们通过研究揭示了新型的癌症潜在治疗性靶点，并针对当前的癌症药物靶点提出了新的见解，也扩大了未来治疗这种疾病的可能性。

利用包括整合了来自10种癌症类型的蛋白质组学、基因组学和表观遗传组学数据的综合性方法，研究人员在癌症组织中识别出了特殊蛋白质和小型蛋白或肽类靶点，并通过实验验证了其中许多作为治疗性策略的有希望的候选者。研究者Bing Zhang教授说道，过去的研究经验表明，靶向性治疗（即针对中特定蛋白的癌症疗法）相比传统放疗和化疗而言或能取得更有效的临床治疗结果。尽管目前科学家们在识别特定癌症类型的潜在弱点方面取得了一定的进展，但FDA批准的癌症药物仅能靶向作用不到200种蛋白，这项研究中，研究人员对来自10种癌症类型的1000多种组织样本的数据进行分析，有望大大扩展潜在治疗靶点的列表。

研究人员应用计算工具整合了蛋白质基因组学的数据，其中就包括DNA、RNA和蛋白质的全基因组信息，这些信息是由临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）的研究人员从前瞻性收集的未经治疗的原发性肿瘤样本中产生的，其中他们将许多与匹配的正常邻近组织进行研究和比较。研究人员将CPTAC数据集与其它公共数据集整合在一起来调查在多种肿瘤类型中所发现的基因和蛋白质改变之间的相似性和差异性，只在阐明癌症疗法的新型蛋白靶点。

泛癌症蛋白质基因组学或有望揭示癌症治疗性靶点蓝图

图片来源：Cell (2024). DOI:10.1016/j.cell.2024.05.039

研究者的目的就是更好地理解已知药物靶点的特性，他们也希望能识别出新的靶点从而帮助开发新型药物。文章中，研究人员应用数据整合方法系统性地识别出了对癌症生长和发生非常重要的蛋白质和基因，比如，在癌症组织中过量表达或过度活跃的蛋白质在正常组织中却不会出现这种现象，以及肿瘤抑制基因的缺失，这或许就会产生对其它蛋白质的依赖，从而就能被治疗性靶向作用；此外，研究人员还开始寻找肿瘤抗原，包括新抗原，其是从肿瘤基因突变中所衍生的癌症特异性肽类。

研究者Zhang表示，我们的研究揭示了重新定向当前用于治疗其它疾病的药物的新用途，比如，我们就发现，一种抗真菌药物能减少多种癌症类型的生长，这就进一步支持了探索这种药物的抗癌价值。研究人员还识别了目前并没有药物的潜在蛋白靶点，其中一些是称之为激酶的酶类，而另一些则是细胞表面蛋白，这些研究发现或能为研究人员开发新型药物提供新的机会，包括小分子药物或药物-抗体偶联物等。

此外，研究人员还计算识别了多种不同癌症类型所共享的肿瘤相关蛋白质，随后他们在实验室培养的细胞和动物模型中实验验证了其对癌症研究的重要性，并验证了这些蛋白质或能作为潜在的治疗性靶点进一步进行研究。最后研究者Zhang表示，我非常激动，因为我们已经创造了一个全面的蛋白质靶点资源库，并能通过识别多种新型候选者和涵盖多种治疗方式，从而就能显著扩大治疗领域，目前我们已经在网站上公开了相关研究发现，我们也希望这一资源能为科学家们重新定向当前可用药物以及开发新型癌症疗法提供新的路径。（100yiyao.com）

参考文献：

Sara R. Savage,Xinpei Yi,Jonathan T. Lei，et al. , Cell (2024). DOI:10.1016/j.cell.2024.05.039

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