Nat Genet：新办法提醒基因“加强子”的任务机理

2019年10月16日讯 /BIOON /--来自日本理化研讨所（RIKEN）综合医学迷信中间和分子研讨所(IFOM)的研讨人员与京都年夜学、卡罗林斯卡研讨所和DNAFORM的协作者一路开辟出了一种被称为NET-CAGE的新技巧，提醒了基因组中被称为加强子的非编码基因的构造，加强子可以激活特定基因的功效。基因组的这些部门已经被以为是不主要的，被称为"渣滓DNA"，如今已知与各类疾病有关，懂得它们的功效曾经成为研讨的一个主要目的.

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如今我们晓得有两品种型的基因组区域，即启动子和加强子，它们的感化是调和卵白质编码基因的激活，实质上是经过激活它们来完成的。启动子就在它们激活的基因旁边，而加强子则在很远的处所，但它们也会以某种方法对基因起感化。人们曾经开辟了多种技巧来测验考试绘制加强子图谱，但它们都有局限性，例如，要么缺少辨认的敏理性，无法准确定位区域的地位，要么不合适在冷冻细胞中应用。

为了克制这些限制，研讨人员开辟了一种称为NET-CAGE的办法，它是RIKEN开辟的CAGE技巧的延长，可以辨认基因组的非编码区域，敏锐度很高，并用于检测五种常用的癌细胞系。他们很快乐地发明，这种办法可以用于冷冻保管的细胞。

应用这种新办法，研讨人员在加强子方面获得了一系列风趣的发明。起首，他们在人类身上发明了多达2万个新的加强子。他们发明，固然多种细胞类型中的启动子被激活，但加强子往往只在一种细胞类型中发扬感化，从而显示出两品种型区域之间的主要差别。他们还发明了这两种区域之间风趣的接洽，标明它们是依据细胞类型的特别性在拓扑上接洽在一路的。此外，他们还以高核苷酸分辩率在被称为"超等加强子"的聚类区域内准确定位了活性加强子。

RIKEN的Yasuhiro Murakaw表现："我们发明加强子在生成细胞类型特异性转录组中起着至关主要的感化。本研讨开辟的新办法可用于生物学的很多方面的研讨。从久远来看，这种办法可以使用于下一代基因组医学。"

"应用这项技巧，"他持续说，"我们正在绘制一幅人体加强子激活的综合地图。经过将这些常识与与疾病相干的渐变数据和癌症基因组数据联合起来，我们愿望能加深对疾病机制的懂得。"这项研讨揭橥在《Nature Genetics》杂志上。（100医药网100yiyao.com）

参考材料：

Shigeki Hirabayashi et al.， Nature Genetics (2019). DOI： 10.1038/s41588-019-0485-9