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Cell:开辟出光学混杂挑选技巧,可在几天内挑选人细胞中的数千个基因

2019年10月26日讯/BIOON/---迷信家们平日应用遗传筛查一次扰动哺乳植物细胞中的基因或改动其活性,以便懂得这些基因的感化。混杂挑选(pooled screening)采取雷同的办法,但平日触及在全部基因组中停止更多的搅扰。然则,当停止混杂挑选时,迷信家们仅能追细胞存活和其他复杂的全细胞测量目标。

显微镜是一种主要的对象,可让生物学家在高分辩率下同时测量很多细胞特点。人们试图将筛查与显微镜相联合来研讨基因对一系列细胞行动的影响,然则一次研讨一个基因既昂贵又费时。

现在,在一项新的研讨中,来自美国麻省理工学院和布罗德研讨所的研讨人员开辟出一种办法,该办法将年夜范围混杂挑选与基于图像的细胞行动剖析相联合。这种称为光学混杂挑选(optical pooled screen)的办法许可人们在空间和工夫分辩率下研讨基因若何影响细胞进程,而其他的混杂挑选办法则无法做到这一点。相干研讨成果揭橥在2019年10月17日的Cell期刊上,论文题目为“Optical Pooled Screens in Human Cells”。论文通信作者为布罗德研讨所焦点研讨所成员、麻省理工学院生物工程系副传授Paul Blainey博士。论文第一作者为Blainey 试验室博士后研讨员Avtar Singh和Blainey 试验室物前理学博士生David Feldman。基因编纂年夜牛张锋(Feng Zhang)也是这篇论文的配合作者。

图片来自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.09.016。 Singh说,“经过这种新办法,任何人都可以在无需专门装备的情形下应用显微镜在几天内筛查数千个基因。”

这些研讨人员经过对数百万个细胞中一种称为p65的卵白的细胞地位停止成像,研讨了952个基因对一种称为NF-kB的免疫调理复合物的旌旗灯号转导活性的影响。他们发明了两个基因---MED12和MED24---在NFkB旌旗灯号弛豫进程中的新感化。

Feldman说:“经过显微镜不雅察活细胞,人们可以不雅察到基因若何影响工夫和空间中的生物进程,这是其他办法无法随便捕捉的。”(100医药网 100yiyao.com)

参考材料:

1.David Feldman et al. . Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.09.016.

2.Imaging combined with genetic screening of cells enhances genomic discoveries

https://phys.org/news/2019-10-imaging-combined-genetic-screening-cells.html

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