Genome Biol:开辟出无望辨认致癌病原体的新办法 |
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2019年11月4日 讯 /BIOON/ --近日,一项登载在国际杂志Genome Biology上的研讨申报中,来自东英吉利亚年夜学等机构的迷信家们经过研讨开辟了一种新办法来寻觅与癌症相干的和病毒。
图片起源:CC0 Public Domain
现在研讨人员曾经发明,某些沾染与癌症产生直接相干,比方胃癌和宫颈癌等;这项研讨中,研讨者经过研讨提醒了若何对来自的基因组数据停止测序来提醒与其产生相干的和病毒,相干研讨成果或能协助检测致癌微生物,将来有一天或能协助开辟多种癌症疫苗,比方HPV疫苗等。
研讨者Dan Brewer博士说道,某些沾染与癌症产生存在分明联系关系,比方,消化道中幽门螺杆菌的存在就会激发,并与胃癌产生直接相干;某些类型的HPV也会激发宫颈癌;跟着人类进入到基因组医学时期,现在研讨人员对人类组织停止全基因组测序的任务也越来越多,当对样本停止全基因组测序时,来自任何病原体的DNA也可以被停止测序,这就无望协助研讨者检测和定量病原体。
是以,研讨人员就能应用所搜集的数据来辨认、病毒和分歧类型癌症之间的联系关系;文章中,研讨人员开辟了盘算机模仿技巧,当对真正的癌症测序数据停止剖析之前,其能对多种办法就停止验证,并在这些数据中寻觅一些风趣的病原体;在模仿试验中,研讨人员制作了包括年夜部门人类基因组序列的“模仿”基因组,同时还在个中参加了大批的病原体序列,而这恰是研讨人员愿望在癌症序列中所不雅察到的。
当研讨者在每一个模仿的基因组中发明病原体并对其停止定量剖析后,他们就可以检测每一种办法能否可行;研讨者除了发明与癌症产生相干的病原体外,他们还可以发明更多病原体,今朝研讨人员才方才开端研讨肯定这些病原体在癌症产生进程中所饰演的症结脚色。最初研讨者Brewer表现,现在人们所打针的HPV疫苗可以无效预防年夜约70%的宫颈癌病例,我们愿望前期可以经过更为深化的研讨辨认出与其它癌症产生相干的和病毒,从而开辟出无效预防癌症产生的新型疫苗。(100医药网100yiyao.com)
原始出处:
Abraham Gihawi, Ghanasyam Rallapalli, Rachel Hurst, et al. , Genome Biology (2019). DOI:10.1186/s13059-019-1819-8
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