plos biology：我们对基因表达数据存在广泛曲解

2019年11月14日 讯 /100医药网BIOON/ --数据可反复性不断以来都是试验生物学的一个次要成绩，跟着基因组技巧的成长以及相干数据庞杂性的不时进步，这一成绩的严重性又获得了很年夜水平地晋升。

11月12日，特拉维夫年夜学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS Biology》上揭橥文章，指出RNA-seq技巧发生的数据常常呈现技巧偏向，进而招致毛病的结论。

经过剖析数十个可地下取得的，针对细胞对多种分歧压力的反响的RNA-seq数据聚集， Mandelbaum及其同事留意到，长渡过短或过长的基因聚集重复显示出表达程度的变更。

(图片起源：Www.pixabay.com)

作者对此觉得迷惑，然后试图搞清晰这一景象面前毕竟是真实的生物学反响，照样试验进程引入的工资误差。为懂得决这个成绩，他们比拟了雷同生物学前提下的反复批次的样本。反复样品之间基因表达的差别可以反应与生物学身分有关的技巧性影响。成果标明，在分歧的反复中，长渡过短或过长的基因都显示出“表达差别”，是以这一景象似乎是基因长度差别惹起的“技巧性误差”。

RNA-seq试验的次要目标是表征受特定身分影响而被激活或克制的生物学进程。Mandelbaum及其同事证实，在很多RNA-seq数据集中，基因长度偏向以及统计剖析中的一些缺点会招致对特定生物学功效呈现毛病辨认。经过清除这种成见，可以滤过滤虚伪信息，同时保存了生物学上真实信息。（100医药网100yiyao.com）

资讯出处：

原始出处：Shir Mandelboum, Zohar Manber, Orna Elroy-Stein, Ran Elkon. PLOS Biology, 2019; 17 (11): e3000481 DOI: 10.1371/journal.pbio.3000481