研讨宣布碧凤蝶染色体程度基因组

蝴蝶因其丰厚的形状多样性，自达尔文时期就作为研讨物种顺应性退化的主要类群之一，近几年更被以为是研讨形状遗传、退化和发育的幻想模子，已成为发育生物学、退化生物学、种群学、维护生物学和生态学等研讨范畴的主要形式生物之一。凤蝶科是具有主要退化位置的蝴蝶支系，其丰厚的颜色和形状等多样性是虫豸生态与退化研讨的主题。

中国迷信院昆明植物研讨所科研团队在2015年完成一切蝴蝶形式种金凤蝶及其近缘种柑橘凤蝶两种凤蝶基因组(Li et al.， 2015， Nature Communications)的根底上，对普遍散布在东亚、南亚以及西北亚并对体色退化及物种分化具有主要研讨意义的碧凤蝶Papilio bianor Cramer， 1777停止了基因组研讨。应用三代长读长测序技巧(PacBio)，联合高通量染色体构象捕捉(Hi-C)技巧，胜利地组装了碧凤蝶染色体（29条常染色体和1条性染色体）程度的基因组，这是首个应用Hi-C技巧完成的染色体程度的蝴蝶基因组。该基因组总长约为421.52 Mb，contig N50与scaffold N50辨别高达5.50 Mb和12.51 Mb。基因组正文的成果标明碧凤蝶基因组年夜小的一半以上为反复序列（233.09 Mb， 55%），是一切已揭橥的蝴蝶基因组中反复序列最高的基因组。正文到的卵白编码基因共15375个。应用4D位点以及直系同源基因构建的退化树提醒凤蝶属来源于39-57百万年之间，碧凤蝶与柑橘凤蝶和金凤蝶的不合工夫在23-35百万年之间。经过PSMC对碧凤蝶的汗青种群静态停止剖析成果显示，碧凤蝶种群从比来的一次间冰期开端添加，直至末次盛冰期为止，这与先前对其他虫豸的研讨成果分歧。碧凤蝶染色体程度的参考基因组不只为研讨碧凤蝶特别生物学特征的和分子机制奠基了根底，也为凤蝶甚至全部蝴蝶资本开辟和生物多样性维护供给了根底材料。(100yiyao.com）