研讨开辟单细胞空间转录组数据剖析可视化平台

单细胞测序技巧是一种在单细胞程度上对基因组、转录组、表不雅组等停止高通量测序剖析的技巧。单细胞测序技巧可以在组学程度提醒细胞间的异质性。单细胞程度细胞谱系追踪技巧位居2018年Science 杂志评选的十年夜迷信冲破之首。惯例单细胞转录组测序技巧丧失了细胞在原组织中至关主要的空间地位信息，而单细胞空间转录组技巧在停止单细胞转录组测序的同时保存并记载了细胞的空间地位信息。空间转录组技巧可以提醒细胞间的互相感化以及细胞所处的微情况，将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学、微情况等范畴的研讨利器。11月12日，《核酸研讨》（Nucleic Acids Research）在线揭橥了中国迷信院生物物理研讨所高通量测序中间标题为SpatialDB： a database for spatially resolved transcriptomes 的论文，宣布第一个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化平台。SpatialDB零碎收录了来自5个物种由8种空间转录组技巧发生的数据，树立了空间转录组数据剖析处置流程，完成了空间转录组数据的在线可视化，同时供给了空间差别表达基因及其功效富集剖析的正文。中科院院士、生物物理所研讨员陈润生以及初级工程师陈小伟为论文配合通信作者。生物物理所高通量测序中间初级工程师范珍为论文第一作者。该研讨取得中科院症结技巧人才项目、国度天然迷信基金和国度重点研发项目标赞助。(100yiyao.com）