Karius公司如何用5毫升血液检测1000多种病原体？

传染病是由，病毒，寄生虫，或真菌等致病微生物引起的疾病，可直接或间接地在人与人之间传播。根据世界卫生组织（WHO）在2016年的统计数据显示，传染病是全球第四大死亡原因。

近日，位于美国加州的生命科学初创公司Karius宣布完成1.65亿美元B轮融资，以推进其专有的“微生物无细胞DNA”技术（mcfDNA）的开发，旨在帮助医生更快速，方便的传染病。此前，该公司于2017年完成5000万美元A轮融资。据悉，该技术通过一次抽血（约5毫升血液），即可在24小时内完成1000多种病原体的检测，其中包括传统检验方法无法识别的感染。如此高效的mcfDNA技术到底是什么？

感染人体不同部位的微生物会在血液中留下它们的DNA痕迹，这被称为mcfDNA。Karius公司开发的检测技术结合了算法，新一代测序技术（NGS）和人工智能方法，可以从血液中识别和测量临床相关病原体（包括、真菌、DNA病毒，和寄生虫）的mcfDNA，让医生了解可能影响患者健康的微生物类型和数量。在处理过程中，该技术会先从血浆样本中提取无细胞DNA片段，并转化为DNA测序文库，并利用Illumina公司开发的新一代测序技术对DNA进行测序，计算mcfDNA的绝对浓度并与对照组进行比较。这使得该公司能够确定哪些微生物对标本中的mcfDNA水平造成显着影响。

去年，在《自然·微生物学》（Nature Microbiology）上曾公布了Karius公司首款产品Karius Test的分析和临床验证结果。与标准方法相比，该检测可以更准确，快速地识别出引起感染的潜在病原体。在近期的同行评审研究（peer-reviewed studies）中还提出了该检测在各种严重疾病患者群体中的实际临床应用。例如，免疫功能低下的患者容易受到各种严重感染的侵害，并经常需要侵入性检测方法来鉴定病原体。在一项针对免疫功能低下儿童患者的研究中，该检测以非侵入性的方式识别出了导致感染的病原体，其检测频率高于侵入式检测。在这些儿童患者中有将近三分之二的侵入式检测过程是可以避免的。此外，还有其它研究支持该检测在其他疾病中的使用，包括复杂的肺炎、侵袭性真菌感染，和心内膜炎。这些研究证明了mcfDNA在帮助临床医生快速做出关键治疗决定方面的价值。目前，Karius Test已在全美100多家医院和医疗机构中使用。

“该轮融资将推动Karius公司临床研究的发展，加速技术的创新，使我们更好的帮助患者，”Karius公司首席执行官Mickey Kertesz博士说：“我们很荣幸可以成为第一批提供mcfDNA检测临床应用的公司之一。”

“Karius公司的创新mcfDNA技术能够准确其他现有技术无法检测的感染，”该轮投资的领投方软银（SoftBank Investment）公司高级执行合伙人Deep Nishar先生说：“我们很高兴可以借此机会支持Karius公司，及其利用基因组见解与传染病抗争的使命。”(100yiyao.com）