Cancer Cell：年夜范围的癌症卵白质组剖析提醒癌细胞对药物疗法发生反响后的卵白质特征改动

2020年11月11日 讯 /BIOON/ --近日，一篇揭橥在国际杂志Cancer Cell上的研讨申报中，来自德克萨斯年夜学MD安德森癌症研讨中间等机构的迷信家们经过对癌细胞系在药物疗法中所发生的卵白质改动停止年夜范围的特征剖析，无望协助猜测癌细胞对药物的敏理性，以及懂得癌细胞的耐药机制并辨认出最佳的疗法战略组合。

研讨者表现，当停止了包含168种分歧化合物的医治后，他们在300多种细胞系中不雅察到了超越200种临床相干卵白质的表达产生了改动，这或许就能作为研讨癌细胞系中卵白质对药物疗法所发生反响的最年夜范围的数据库；Han Liang博士说道，我们看到了一些搅扰性的研讨，这些研讨剖析了药物疗法后的基因表达改动或CRISPR介导的改动，但这在剖析方面或许还存在明显的差距，我们愿望能经过对次要医治性靶点卵白改动停止剖析来弥补这一空白，同时还无望协助说明癌细胞的耐药机制并设计出新型药物组合性疗法。

图片起源：Dr.Cecil Fox,National Cancer Institute

研讨者说明道，搅扰生物学研讨能测定诸如癌细胞等零碎对多种安慰做出的反响，现在这些类型的试验曾经证实能用于模仿癌症的行动并在零碎层面下去懂得药物的反响；为了可以对卵白质的扰动停止剖析，研讨人员应用反向卵白质剖析技巧（RPPA，reverse phase protein array）对选择的一组卵白质停止疾速的定量剖析，而在基线和医治后，研讨人员平日能在多个工夫点来测定卵白质的程度。文章中，研讨人员还对319种最常应用的多种癌细胞系（包含、卵巢癌等）停止研讨，剖析了药物靶向感化多种旌旗灯号通路和细胞进程的感化后果。

比拟剖析一切能够的药物-细胞系组合而言，研讨人员共剖析了15，492份样本，个中包含11，884份药物医治的样本和3，608对比样本，并且相干研讨数据具有较高的可反复性，其能被多种自力的门路所验证。经过剖析所获得的数据能供给主要的线索来说明癌细胞对药物反响或耐受性的机制，同时还强调了能被既定药物疗法所激活或克制剂的特别旌旗灯号通路，此外，拥有基线和医治后卵白程度的相干数据也可以在建模猜测癌细胞对其它药物敏理性上加倍有效。

此外，研讨人员还绘制出了卵白质-药物联系关系性的片面图谱，从而就能加倍清晰地不雅察癌细胞对药物的反响，并更好地舆解分歧卵白质和旌旗灯号通路之间的联系关系，这些图谱或能协助说明哪些卵白质在患者服药后发生了明显的改动，哪些药物发生了类似的反响，以及哪些卵白质呈现了类似的变更形式，而研讨这些庞杂的联系关系或无望提醒未知的关系，并可以协助开辟加倍无效的组合性疗法。基于构建的数据库，迷信家们就可以立即不雅察到给定药物所发生的反响，包含搅扰的通路和顺应性的反响等，同时还能协助肯定最佳的药物组合。跟着研讨人员进一步扩规模，这或许就能作为一个十分有价值的终点来协助研讨人员停止药物的机制性研讨。

虽然本文研讨只包含了癌症类型的一个子集，前期研讨人员愿望持续深化研讨来添加数据库，而从久远看来，基于基线和疗法后的卵白质组特征剖析或无望作为临床中一种十分无效的对象，其可以协助研讨者更好地追踪患者对疗法的反响并优化前期的医治性战略。（100医药网100yiyao.com）

原始出处：

Wei Zhao，Jun Li，Mei-Ju M.Chen, et al. , Cancer Cell (2020). DOI:10.1016/j.ccell.2020.10.008