两篇Science论文构建出胎儿基因表达和染色质可及性的人类细胞图谱,有助提醒人细胞发展和发育机制 |
![]() |
2020年11月16日讯/BIOON/---在两项新的研讨中,来自美国华盛顿年夜学医学院和布罗特曼-巴蒂精准医学研讨所等研讨机构的研讨人员构建出两个细胞图谱,用于追踪人类细胞类型和组织发育进程中的基因表达和和染色质可及性(chromatin accessibility,也译为染色质可拜访性)。个中的一个细胞图谱绘制了15种胎儿组织中单个细胞内的基因表达,另一个细胞图谱绘制了这些细胞内单个细胞的染色质可及性。相干研讨成果揭橥在2020年11月13日的两篇Science论文中,论文题目辨别为“A human cell atlas of fetal gene expression”和“A human cell atlas of fetal chromatin accessibility”。
这些图谱配合为懂得人类发育进程中的基因表达和染色质可及性供给了范围绝后的根底资本。此外,这两篇论文中描绘的技巧使得生成数百万个细胞的基因表达和染色质可及性数据成为能够。
除了华盛顿年夜学医学院和布罗特曼-巴蒂精准医学研讨所之外,来自Illumina公司、亚利桑那年夜学、弗雷德-哈钦森癌症研讨中间、马克斯-普朗克分子学研讨所和罗切斯特年夜学医学中间的协作者也为这两项研讨做出了奉献。
基因表达图谱
第一项新的研讨触及第一个细胞图谱,即基因表达图谱。基因表达是细胞应用它的DNA中贮存的指令指点卵白分解的进程。这些卵白又决议了细胞的构造和功效。基因表达图谱绘制了分歧类型细胞发展发育进程中基因表达产生的地位和工夫。
图片来自Science, 2020, doi:10.1126/science.aba7721。
第一篇论文的第一作者、华盛顿年夜学医学院基因组迷信传授Jay Shendure试验室的博士后研讨员Junyue Cao说,“从这些数据中,我们可以直接生成人类组织中一切次要细胞类型的目次,包含这些细胞类型在分歧组织中的基因表达能够若何产生变更。”
Shendure说,“该范畴有一个总体目的,就是在尽能够普遍的规模内,以尽能够高的分辩率来描画人类的法式。”
为了创立基因表达图谱,这些研讨人员经过应用一种名为 sci-RNA-seq3 的技巧,对 15 种胎儿组织的基因表达停止了分析。这种技巧为每个细胞贴上了三个DNA条形码的共同组合标签,从而使得他们可以在不停止物理别离的情形下跟踪这些细胞。
在这些取得DNA条形码序列后,他们应用盘算机算法取得单细胞信息,按细胞类型和亚型对细胞停止聚类,并肯定它们的发育轨迹。他们对400多万个单细胞停止了分析,肯定了77种次要的细胞类型和年夜约650种细胞亚型。
他们还将该基因表达图谱与现有的小鼠胚胎发育图谱停止了比拟。第一篇论文的配合通信作者、华盛顿年夜学医学院基因组迷信副传授、布罗特曼-巴蒂精准医学研讨所研讨员Cole Trapnell说明说,“当我们将这些数据与之前颁布的数据联合起来时,我们可以直接绘制出一切次要细胞类型的细胞发育途径。”
染色质可及性图谱
医药网新闻
- 相关报道
-
- 《自然》:减重影响真的很大!科学家分析近20万细胞,发现减重可逆转肥胖导致的细胞衰老,但促炎巨噬细胞持续存在,或为反弹原因 (2025-07-11)
- Nature头条:尼安德特人比我们想象的更聪明,比人类早10万年掌握“炼油”技术 (2025-07-11)
- 医保钱包开明地域再扩容,快来看看有您的他乡吗 (2025-07-10)
- STTT:上海九院李青峰/谢峰团队揭示巨痣/兽皮病致病新机制,并提出治疗新策略 (2025-07-10)
- Science重磅发现:人类成年后乃至老年时,大脑海马体中仍在持续产生新的神经元,有助于记忆和学习 (2025-07-10)
- 体脂率多少的男/女性最具吸引力?三项科学研究揭露“完美身材”:男性体脂率13-14%+肩腰比1.57;女性完美身材则更为严格 (2025-07-10)
- STTT:中科院/南开团队发现,膜蛋白TfR1可入核“劫持”p53,增强癌细胞DNA损伤修复功能,对抗化疗 (2025-07-10)
- Nat Commun:大脑“幕后操控者”现身!科学家揭秘纹状体星形胶质细胞如何影响机体肥胖与代谢? (2025-07-09)
- Gut:四川大学团队发现肠癌“催肥肝脏”,为后续肝转移作铺垫的关键机制 (2025-07-09)
- 解读:制止将“空肠回肠吻合术”利用于2型糖尿病医治 (2025-07-09)
- 视频新闻
-
- 图片新闻
-
医药网免责声明:
- 本公司对医药网上刊登之所有信息不声明或保证其内容之正确性或可靠性;您于此接受并承认信赖任何信息所生之风险应自行承担。本公司,有权但无此义务,改善或更正所刊登信息任何部分之错误或疏失。
- 凡本网注明"来源:XXX(非医药网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。本网转载其他媒体之稿件,意在为公众提供免费服务。如稿件版权单位或个人不想在本网发布,可与本网联系,本网视情况可立即将其撤除。联系QQ:896150040