研讨提醒phasiRNA的退化机制及感化特色

植物pha（phased，secondary，small interfering RNA）是由一些22nt 引诱，依附RDR6，最终由特定DCL卵白对双链RNA持续切割构成具有相位散布的次级小RNA。禾本科植物生殖发育阶段的花药中年夜量表达21nt和24nt的phasiRNA，辨别由miR2118和miR2275引诱。phasiRNA分解通路症结基因的渐变均影响水稻花粉育性，研讨发明，与两系法杂交水稻亲密相干的光敏不育位点pms1和pms3也是phasiRNA的发生位点，这阐明这些小RNA在水稻生殖发育进程中发扬了主要感化。但是，学界尚不清晰这些phasiRNA的感化方法、靶位点和发生位点的退化纪律。

中国迷信院与发育生物学研讨所研讨员陈明生课题组历久从事稻属的比拟研讨。近期，研讨人员经过比拟剖析五个具有代表性的稻属物种中的phasiRNA位点（PHAS），联合高通量的小RNA和降解组测序剖析，发明了年夜量新的PHAS位点，个中年夜部门来自非编码的基因间区。研讨指出，部分区域的串联反复是PHAS位点在基因组中扩大的次要方法，并形成其成簇散布；PHAS位点的序列在物种间疾速分化，序列不保守，仅在miR2118或miR2275的辨认位点遭到强的选择，PHAS的散布地位在近缘物种间绝对保守。此外，具有5"尿苷（U）的21nt-phasiRNA偏向于在PHAS前体处介导顺式切割，这些切割位点在近缘物种中也产生了明显变更。miR2118可在其本身的自然反义转录本中引诱发生phasiRNA，而且发生的这部门phasiRNA具有反向调理miR2118前体的潜在感化。依据上述成果，研讨人员揣测，这些生殖相干的phasiRNA的肇端分解进程绝对保守，而phasiRNA产品在物种间敏捷分化，缺少保守的感化位点，phasiRNA的发生进程遭到多种反应调理机制的交互感化。(100yiyao.com）