研讨提醒RNA病毒聚合酶具备一个与宿主顺应相关的特征区域

RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，简称RdRP）是一类共同的核酸聚合酶，在病毒基因组复制和转录进程中发扬焦点作用，是抗病毒药物研讨的热门靶标。病毒的RdRP因为可与其他功效域交融或与其他病毒卵白共折叠，其整体构造多样性较高，但其催化焦点区的三维构造则较为激进，是以RdRP兼具多样性和激进性。因为RNA病毒的宿主范畴简直席卷了一切细胞模式的性命体，在与分歧宿主的独特退化进程中，RdRP作为RNA病毒最激进的卵白，其与病毒的宿主顺应性之间的联系关系并不清晰。

黄病毒包含乙型脑炎病毒（Japanese encephalitis virus，简称JEV）、登革病毒（dengue virus，简称DENV）、寨卡病毒、蜱传脑炎病毒（tick-borne encephalitis virus，简称TBEV）等多种人类致病病原，是一类散布普遍、品种单一的单股正链RNA病毒，与丙型肝炎病毒和经典猪瘟病毒同属于黄病毒科。黄病毒年夜多由吸血节肢植物如蚊和蜱作为序言传达，可惹起人类脑炎或出血性疾病，对人类安康组成严重威逼。黄病毒的RdRP位于病毒编码的非构造卵白NS5的羧基端，与氨基真个甲基转移酶（MTase）造成人造交融体。此前蚊传黄病毒的NS5已有多个三维构造报道，包含全长卵白、MTase区和RdRP区的构造，而蜱传黄病毒NS5卵白的全长构造及RdRP三维构造则未获解析。

中国迷信院武汉病毒研讨所研讨员龚鹏团队恒久从事病毒RdRP的催化与调控机制研讨，此前已别离解析了JEV和DENV的NS5全长卵白晶体构造（Lu and Gong， PLoS Pathogens 2013； Wu et al.， PLoS Pathogens 2020），并与武汉病毒所研讨员张波团队单干，体系性提醒了NS5的构象多样性和激进性以及MTase调控RdRP的分子机制（Li et al. PLoS Neglected Tropical Diseases 2014； Wu， et al. Journal of Virology 2015； Wu et al.， PLoS Pathogens 2020）。科研职员近期解析了分辩率为1.9埃的TBEV MTase晶体构造（PDB号7D6M，图1A）和分辩率为3.2埃的TBEV RdRP的晶体构造（PDB号7D6N，图1B），得到了首个蜱传黄病毒RdRP的三维构造信息。通过黄病毒RdRP的序列阐发以及与构造已知的蚊传黄病毒RdRP的构造进行比拟，发当初RdRP激进的催化基序（motif）B和C之间存在一个值得存眷的区域（以下称B-C连贯区）。该区域位于RdRP手掌区的底部且裸露于卵白外表，且在黄病毒属的分歧宿主分类中具备显明的宿主相关多样性（图1B及图2）。

研讨设计了TBEV和JEV病毒间B-C连贯区的替换渐变，在酶学程度证明渐变对RdRP催化功效不组成实质影响（图3A、B）。龚鹏团队与武汉病毒所研讨员王汉中/郑振华团队和张波团队单干，在细胞程度别离评测渐变对TBEV和JEV的影响，研讨标明在两种病毒系统中渐变后的病毒不克不及维持在细胞中的增殖（图3C、D）。这些成果提示B-C连贯区很能够参加了RdRP催化以外与病毒增殖相关的紧张进程。通过对正链、负链和双链RNA病毒中的代表性RdRP的B-C连贯区进行构造与序列的体系阐发，在RNA病毒年夜家族中发现该区域在构造和序列长度方面具备较高的多样性（图4），提示RdRP的B-C连贯区很能够是RNA病毒共有的一个宿主顺应热门区域，该研讨为病毒RdRP的调控机制研讨及RdRP相关的宿主顺应研讨提供了紧张线索。(100yiyao.com）