从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚构造 |
![]() |
美国德克萨斯年夜学MD安德森癌症中间Nicholas E. Navin团队开辟出新办法,可从单细胞转录组中解析出人类中的拷贝数和克隆亚构造。该研讨于近日在线颁发于国内一流学术期刊《自然—生物技术》。
研讨职员表现,单细胞转录组学阐发被普遍用于研讨人类肿瘤。然而,将肿瘤微情况中的正常细胞类型与恶性细胞区离开并解析内的克隆亚构造仍旧具备挑战性。
为相识决这些挑战,研讨职员开辟了一种集成的贝叶斯联系办法,称为非整倍体肿瘤的拷贝数染色体核型阐发(CopyKAT),这个办法可能在高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中以均匀5 Mb的基因组分辩率来预算基因组拷贝数。研讨职员使用CopyKAT阐发了21种中的46,501种单细胞,包含三阴性、胰腺导管腺癌、间变性甲状腺癌、浸润性导管癌和胶质母细胞瘤,并精确地(98%)区分了癌细胞与正常细胞类型。
在三种乳腺肿瘤中,CopyKAT解决了克隆性亚群,这些亚群在癌症基因(例如KRAS)的表白和特征(包含上皮到间质转化、DNA修复、和缺氧)方面有所分歧。这些数据标明,CopyKAT可以帮忙阐发各类实体人类中的scRNA-seq数据。(100yiyao.com)
医药网新闻
- 相关报道
-
- 医药推销回款减速度:企业资金周转按下快进键 (2025-07-11)
- 《自然》:减重影响真的很大!科学家分析近20万细胞,发现减重可逆转肥胖导致的细胞衰老,但促炎巨噬细胞持续存在,或为反弹原因 (2025-07-11)
- Nature头条:尼安德特人比我们想象的更聪明,比人类早10万年掌握“炼油”技术 (2025-07-11)
- 医保钱包开明地域再扩容,快来看看有您的他乡吗 (2025-07-10)
- STTT:上海九院李青峰/谢峰团队揭示巨痣/兽皮病致病新机制,并提出治疗新策略 (2025-07-10)
- Science重磅发现:人类成年后乃至老年时,大脑海马体中仍在持续产生新的神经元,有助于记忆和学习 (2025-07-10)
- 体脂率多少的男/女性最具吸引力?三项科学研究揭露“完美身材”:男性体脂率13-14%+肩腰比1.57;女性完美身材则更为严格 (2025-07-10)
- STTT:中科院/南开团队发现,膜蛋白TfR1可入核“劫持”p53,增强癌细胞DNA损伤修复功能,对抗化疗 (2025-07-10)
- Nat Commun:大脑“幕后操控者”现身!科学家揭秘纹状体星形胶质细胞如何影响机体肥胖与代谢? (2025-07-09)
- Gut:四川大学团队发现肠癌“催肥肝脏”,为后续肝转移作铺垫的关键机制 (2025-07-09)
- 视频新闻
-
- 图片新闻
-
医药网免责声明:
- 本公司对医药网上刊登之所有信息不声明或保证其内容之正确性或可靠性;您于此接受并承认信赖任何信息所生之风险应自行承担。本公司,有权但无此义务,改善或更正所刊登信息任何部分之错误或疏失。
- 凡本网注明"来源:XXX(非医药网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。本网转载其他媒体之稿件,意在为公众提供免费服务。如稿件版权单位或个人不想在本网发布,可与本网联系,本网视情况可立即将其撤除。联系QQ:896150040