Nat Commun:在异染色质中,TALEN的编纂效率是CRISPR |
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2021年2月4日讯/BIOON/---在一项新的研讨中,来自美国伊利诺伊年夜学香槟分校的研讨职员应用单分子成像技术对基因组编纂对象CRISPR-Cas9和TALEN进行了比拟。他们的试验显示,在基因组中慎密紧缩的称为异染色质(heterochromatin)的部门,TALEN的编纂效率是CRISPR-Cas9的5倍。软弱X综合征、镰状细胞、β-地中海血虚等疾病都是的缺点形成的。相关研讨成果于2021年1月27日颁发在Nature Communications期刊上,论文题目为“TALEN outperforms Cas9 in editing heterochromatin target sites”。
图片来自Nature Communications, 2021, doi:10.1038/s41467-020-20672-5。
论文通信作者、伊利诺伊年夜学香槟分校化学与生物分子工程传授Huimin Zhao说,这项研讨添加了证据,标明必要更普遍地选择基因组编纂对象来靶向编纂基因组的分歧部门。Zhao说,“CRISPR是一个十分弱小的对象,引发了基因工程反动,但它仍旧有一些局限性。”
CRISPR是一种可以检测入侵病毒的分子。它可以携带Cas9等几种CRISPR相关酶中的一种,使得它可能在特定地位切割病毒基因组。TALEN可以扫描DNA,寻觅并靶向特定基因。CRISPR和TALEN都可以通过基因改革来靶向特定基因,以对立疾病、改善作物动物个性或用于其他利用。
Zhao和他的共事们使用单分子荧鲜明微镜间接察看这两种基因组编纂对象在哺乳植物活细胞中的表示。荧光标志的标签使得这些研讨职员可能丈量CRISPR和TALEN沿着DNA挪动并检测和切割靶位点所需的光阴。
Zhao说,“咱们发现,CRISPR在基因组的不太慎密环绕纠缠的区域中表示更好,然则TALEN可以比CRISPR更好地拜访区域中的基因。咱们还察看到,在异染色质区域,TALEN可以比CRISPR有更高的编纂效率,可以比CRISPR更无效地切割DNA并引发DNA变动。”
在多项针对异染色质的试验中,TALEN的编纂效率是CRISPR的5倍之多。Zhao说,这些发现将有助于改良现有的办法来靶向基因组的各个部门。他说,“要么咱们可以将TALEN用于某些利用,要么咱们可以测验考试让CRISPR在中更好地发扬作用。”(100医药网 100yiyao.com)
参考材料:
1.Surbhi Jain et al. . Nature Communications, 2021, doi:10.1038/s41467-020-20672-5.
2.Genome-editing tool TALEN outperforms CRISPR-Cas9 in tightly packed DNA
https://www.eurekalert.org/pub_releases/2021-01/uoia-gtt012521.php
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