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PNAS:迷信家应用机械培训算法来辨认人类基因组中的陈旧RNA病毒片断!

2021年2月4日 讯 /100医药网BIOON/ --近日,一篇颁发在国内杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研讨申报中,来自日本多个研讨机构的迷信家们通过研讨,胜利应用机械培训算法来从人类基因组中辨认陈旧的RNA病毒残留物,文章中,研讨职员描写了他们若何传授AI体系来辨认RNA病毒残留并应用其在人类基因组中搜刮。

此前研讨成果标明,当个别被病毒感化后,病毒有时就会通过增加本身的RNA来改动宿主的DNA;而其它研讨则标明,在好多年前可能感化群体的陈旧病毒有时会将其RNA残留物留在人类的基因组中,而寻觅诸如斯类残留物关于迷信家们而言有着很年夜的挑战,由于每一种疑似病毒都必要进行年夜量的比拟;而本文研讨中,研讨职员应用机械培训算法来帮忙减速这一研讨。

图片起源:Pixabay/CC0 Public Domain

为了训练这种算法,研讨职员应用来自已知非逆转录内源性RNA病毒元件的RNA,他们的设法主意便是通过应用当代病毒RNA来训练算法,如许这种体系就能相识病毒RNA的年夜体样子,研讨者以为,这种共性能够存在于古代病毒的RNA中;当颠末训练后,研讨职员就能调整该体系来尽能够地预防多种假阳性成果的呈现,随后他们就开端对人类基因组进行研讨并辨认出了快要100种能够性。对这些能够性阐发后,研讨者发现,许多的能够性都是已知的,许多能够性都低于他们所设定的门槛,末了就剩下了一种能够的未知病毒残留。

研讨职员察看了异样的病毒残留是否也会在其它物种的基因组中呈现,比方黑猩猩等;成果发现切实其实如斯;这一研讨发现标明,这一拔出至多产生在4300万年前的物种分解之前的时期。末了研讨者表现,这种新办法或能扩大到研讨其它类型的病毒,同时还能提醒其它的残留物。前期研讨职员还将持续对古代病毒进行深化研讨,并提醒其若何嵌入到人类基因组中,这或者无望帮忙研讨者发现一些当代病毒的特别行动。(100医药网100yiyao.com)

原始出处:

Shohei Kojima,Kohei Yoshikawa,Jumpei Ito, et al. , Proceedings of the National Academy of Sciences (2021). DOI: 10.1073/pnas.2010758118

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