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研讨解析一般小麦亚基因组非对称调控机制

近期,中国迷信院分子动物迷信杰出立异中间和中科院与发育生物学研讨所单干在The Plant Cell上,在线颁发题为An atlas of wheat epigenetic regulatory elements reveals subgenome-divergence in the regulation of development and stress responses的文章,提醒一般小麦亚基因组非对称调控的分子机制,并同期颁发编纂评论文章。

普遍莳植的一般小麦(Triticum aestivum,2n=6x=42,AABBDD)基因组庞年夜(16 Gb)而简单,由3个二倍体祖先草杂交集倍造成,包括3组类似的亚基因组。顺应分歧情况的二倍体基因组交融显着提升了六倍体小麦的情况顺应性。与其祖先种相比,一般小麦具备显明的多倍化劣势,如植株更矮小、种子更丰满、具备更强的抗逆性。已有研讨提醒了一般小麦3套基因组的差别基因及差别表白形式,然而今朝,学界尚不分明亚基因组表白的时空调控特同性调控机制,庞年夜而简单的基因组晦气于深化展开机制研讨。

该研讨中,研讨职员应用定量表观基因组阐发办法,整合分歧发育阶段与情况处置的表观组和转录组数据,鉴定到一般小麦中的上万个基因远端调控DNA元件,并将其与靶基因联系关系。该研讨进一步提醒了表观调控元件在亚基因组间差别的表观构造,该差别决议了靶基因组织特同性表白的差别。调控元件亚基因组差别表观构造的动静变动遭到甲基化酶复合体PcG和去甲基化酶REF6的协同调控。在应答情况刺激进程中,调控元件表观修饰的变动与靶基因的表白变动亲密相关。以此为根底,该研讨预测了钳制相应因子并进行试验验证,进一步提醒了相应因子在亚基因组间的差别联合与亚基因组间调控元件的密度差别及表观修饰的定量差别协同互作。

综上,该研讨提醒了亚基因组非对称调控的分子机制及其在组织发育和顺境相应进程中的特同性作用,为从遗传和表观互作角度解析一般小麦高度可塑性与普遍情况顺应性提供了新线索。(100yiyao.com)

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