让奥米克隆变种人无处可逃！一次放大 双倍覆盖！大支打造ATOPlex V3.0 DNBSEQ测序平台 共同出击

来源：华大知止2021-12-01 14:38

目前，新冠肺炎的超强突变株Omicron(B.1.1.529)正在全球范围内快速传播，给疫情防控监测体系带来了巨大挑战。

目前，新冠肺炎的超强突变株Omicron(B.1.1.529)正在全球范围内快速传播，给疫情防控监测体系带来了巨大挑战。华智ATOPlex V3.0试剂盒可稳定制备覆盖毒株全长序列的测序文库，所有流行毒株均可用DNB测序分析系统进行分类。从Alpha到Omicron，只有一套建库试剂可以为新菌株提供简单有效的监测。

南非一家传染病治疗中心的医护人员正忙于应对新冠肺炎变异病毒的传播(来源/Alet pretorius/Gallo images/Getty)

超强毒株冲击并挑战疫情监测系统。

到当天结束时，新冠肺炎超过2.6亿人被感染，500多万人死亡。根据世卫组织发布的数据，世界疫情经历了三次高峰。11月11日，当第三波疫情被普遍认为正在放缓时，最新变异毒株B.1.1.529超越了流行优势毒株Delta毒株，成为最新的强毒株，被WHO命名为Omicron。根据Nextclade的最新数据，Omicron突变体包含61个氨基酸突变，对应50个核酸序列新突变，包括6个缺失突变和44个碱基置换突变(https://covariants.org/variants/21K。Omicron)。其中，刺突蛋白有30多个突变，其中ACE2受体RBD区有10个突变，可能会影响现有疫苗的疗效。

Omicron突变株突变分布图(来源/斯坦福大学冠状病毒抗病毒及耐药性数据库)

目前，基于多重PCR的测序技术是新冠肺炎病毒株监测的主流技术。从Alpha到Beta，再到Delta，再到最新的Omicron，新冠肺炎在不断变化，每一次变化都给基于PCR技术的测序监测技术带来巨大挑战。

ATOPlex V3.0实现了全长基因组的双覆盖，能够从容应对菌株变异。

基于多重PCR核心技术，华大知止ATOPlex平台推出V3.0数据库构建套件，应对疫情挑战。ATO V3.0套件采用双保险引物设计。在一个实验中，病毒基因组同时被扩增了两次。任何试管都可以扩增接近新冠肺炎的全长序列，有效降低病毒突变导致失败的风险。

ATOPlex V3.0工作原理

如上图所示，Pool1和Pool2两个不同的引物池分别扩增了新冠肺炎的一个完整基因组，有效降低了因菌株突变导致引物扩增失败的风险，为持续有效检测新的未知突变菌株提供了有力保障。

大智昭在第一时间获得Omicron序列后，完成了ATOPlex试剂盒的溯源性评价。ATOPlex V3.0数据库构建试剂盒结合DNBSEQ测序系统可有效分析Omicron菌株，基因组覆盖率超过99.2%，在鉴定新突变的同时可获得完整的基因组序列。

ATOPlexV3.0设备属性

从疫情初期开始，华志昭就一直致力于为疫情监测系统提供最新最好的工具，帮助多个城市和地区第一时间确认新冠肺炎变异毒株的分型，如Alpha、Delta等。11月29日，华大智造帮助瑞典公共卫生局合作的卡罗林斯卡医学院国家疫情中心完成首次奥米克隆监测。

ATOPlex V3.0结合DNBSEQ测序分析系统，可快速响应疫情监测。

ATO V3.0结合DNBSEQ测序系统，可在18小时内完成该菌株的全基因组组装和分型，帮助公共卫生监测系统快速、持续地追踪新冠肺炎变异。

大智招抗疫产品

华志昭密切关注新冠肺炎的突变情况。自疫情早期爆发以来，通过核心产品基因测序仪和自动化设备，为全球70多个国家的疫情防控提供了工具支持。随着疫情形势的不断变化，华大知止将持续更新优化包括数据库建设和测序系统在内的产品和平台，为新的突变和疫情监测提供更有力的工具保障，助力全球抗疫！(100医学网络生物)

版权声明

本网站标注“来源：百医网”或“来源：bioon”的文字、图片、音视频资料均属于百医网网站版权所有。未经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，否则将承担责任。获得书面授权转载时，必须注明“来源：百医网”。其他来源的文章均为转载。本网站所有转载都是为了传递更多信息。转载不代表本网站的立场。不想被转载的媒体或个人可以联系我们，我们会立即删除。

87%的用户在随时阅读、评论、分享百医网APP。请扫描二维码下载-