奥米克龙在南非废水中被发现！大支制造了ATOPlex技术 DNBSEQ平台 来创新废水流行病学的研究方法！

来源：原创网站2021-12-17 09:38

新冠肺炎的超强突变株Omicron(B.1.1.529)近期在全球范围内迅速传播，给疫情防控和监测带来了巨大挑战。大支ATOPlex技术和DNBSEQ测序平台为南非、沙特、瑞典等国Omicron突变株的溯源和监测提供了有力的工具支持。

2021年12月17日/Bion/-超强新冠肺炎突变株Omicron(B.1.1.529)近期在全球范围内迅速传播，给疫情防控和监测带来了巨大挑战。大支ATOPlex技术和DNBSEQ测序平台为南非、沙特、瑞典等国Omicron突变株的溯源和监测提供了有力的工具支持。

大支ATOPlex技术和DNBSEQ平台帮助南非检测废水中的奥米克隆病毒。

目前，新冠肺炎的奥米克龙突变株正在南非迅速传播。南非医学研究理事会(SAMRC)利用华大知止公司制造的ATOPlex数据库构建试剂盒、MGISEQ-200基因测序仪和MGISP-100高通量自动数据库构建平台，第一时间发现了Omicron突变株，并通过该系统在废水样品中发现了Omicron菌株。

图片：SAMRC

SAMRC中心人类学家、平台经理克雷格金涅尔教授表示：“基于华大知止打造的创新技术平台，我们团队对从南非污水处理厂采集的废水样本进行了SARS-COV-2测序，检测出从开普敦采集的12份废水样本中有11份含有Omicron病毒。在奥米克龙突变株发布之前，我们首先在开普敦国际机场采集的废水样本中检测到了奥米克龙病毒。”

大支ATOplex技术实现了Omicron测序的基因组覆盖率超过99.2%。

基于废水的流行病学(WBE)可以在医疗系统检测之前检测到病毒的存在，同时不受无症状感染者的干扰，从另一个层面为新冠肺炎疫情控制提供了新的预警信息，可以帮助相关部门更有效地做出公共卫生决策。传统的基于RT-qPCR的方案可以有效检测废水中是否存在病毒，但无法判断病毒的类型，而多重PCR结合二代测序的方法可以解决这一问题。

大支ATOPlex Kit (V1.1)采用短序列扩增技术(106-199)，覆盖新冠肺炎全基因组，可有效捕获废水中的新冠肺炎片段，并结合DNBSEQ测序获得废水中的病毒序列信息。此次利用ATOPlex技术对废水中的新冠肺炎进行监测，Omicron的基因组覆盖率超过99.2%。鉴定了新的突变，获得了完整的基因组序列。此外，ATOPlex技术结合Spike-in外定量技术，可有效量化废水中病毒浓度，推断社区感染规模，为公共卫生部门制定防控政策提供理论依据。

在微生物研究领域，ATOPlex技术不仅可以对Omicron等新菌株进行有效的分类和监测，还可以为其他威胁人类健康的病原微生物提供个性化的监测方案，从而满足公共卫生领域不同微生物的检测和监测需求。

华智打造了ATOPlex技术的DNBSEQ测序平台，助力沙特和瑞典首个Omicron监测溯源。

此外，华大知止ATOPlex数据库构建套件和MGISP高通量自动化数据库构建平台，帮助与瑞典公共卫生部合作的卡罗林斯卡医学院国家疫情中心第一时间找到了奥米克龙突变株。达志昭还为沙特阿拉伯王国卫生部提供了ATOPlex技术和MGISEQ-2000高通量测序平台，帮助其发现了第一例从北非返回的公民Omicron病例。

疫情爆发以来，华大智造密切关注新冠肺炎的突变情况，通过其核心产品、基因测序仪和自动化设备，为全球70多个国家的疫情防控提供了有力的工具支持，助力抗击全球疫情！(100我

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