细胞:新的研究为癌症转移的基因组基础提供了新的见解 |
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来源:原创网站2022-02-08 17:50
在一项新的研究中,美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSK)研究人员的新发现支持了癌症科学的一个新框架,即癌症转移主要不是由基因突变驱动的,而是由癌细胞和周围环境中正常细胞相互作用引起的表观遗传变化驱动的。
2022年2月8日/Bion/-在一项新的研究中,美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSK)的研究人员做出了新的发现,支持癌症科学中的一个新框架,即癌症转移主要不是由基因突变驱动的,而是由癌细胞和周围环境中正常细胞相互作用引起的变化驱动的。由于90%的癌症死亡是由癌症转移引起的,这一新数据将有助于揭开围绕癌症转移的谜团。相关研究结果发表在2022年2月3日的《细胞》杂志上,标题为“来自25000名患者前瞻性临床测序的代谢模式基因组表征”。
大约六年前,一项合作研究开始确定是否有可能仅根据肿瘤的基因组图谱来预测哪些器官会转移。具体来说,人们想知道许多不同癌症类型中的一些突变或突变组合是否与癌症向特定器官的扩散有关。
该论文的合著者、MSK流行病学和生物统计学系的计算肿瘤学家Nikolaus Schultz博士说,“尽管我们确实发现一些基因突变在具有特定转移转变的肿瘤样本中略微常见,但我们没有发现任何单一基因能够预测发生突变时转移到特定器官的可能性。”
这些作者使用复杂的计算技术从MSK-IMPACT中提取数据。MSK-IMPACT是一个独特的工具,用于发现400多个癌症相关基因的突变,帮助临床医生根据个体基因组变化选择治疗方案。自2014年以来,MSK收集了数千人的遗传肿瘤数据,包括25,000名患有50种不同癌症类型的患者,他们的原发性和转移性特征已被测序(在本项目中进行了分析)。
图片来自cell,2022,doi :10.1016/j . cell . 2022 . 01 . 003
在最高水平上,这些数据表明转移性肿瘤在基因组上不同于原发性肿瘤。在许多——但不是所有——癌症类型中,与原发性肿瘤相比,转移性肿瘤的DNA拷贝数变化更大,科学家称之为。当特定DNA片段的拷贝数大于或小于正常拷贝数时,就会发生DNA拷贝数的变化。当在原发性肿瘤中观察时,拷贝数的这些变化是转移潜能的指标。此外,在不同类型的癌症中,一些驱动癌症的突变在转移性肿瘤中以与原发性肿瘤不同的频率被检测到。
探索这些数据和其他发现的影响将是MSK新成立的玛丽-乔西和亨利-克拉维斯癌症生态系统项目的重点。本项目旨在基于对癌症内在驱动因素(包括基因)的理解和对培养和维持这些危险细胞的环境的新见解,开发新一代治疗方法。这项雄心勃勃的研究和技术开发工作将癌症视为一种系统性疾病——这种疾病始于单一部位,但取决于整个身体的状况才能茁壮成长和扩散。
一般来说,在大规模测序和患者的相关临床数据中可能会发现更多的信息,这可能有助于做出治疗决策。为了帮助科学家挖掘这些新数据以获得更多见解,MSK团队正在通过MSK癌症门户网站(纪念斯隆凯特琳-转移事件和热带病)公开提供这些数据。
舒尔茨博士说,“如果分析得当,这些数据可以告诉我们更多关于这些患者的预后,他们是否会转移,甚至他们可能转移到什么组织。这些信息可能有助于确定如何监测这些患者,或者更多地了解他们可能对哪些治疗更敏感或不敏感。我认为个性化医学有很大的潜力,它不仅仅是单一的,因此有理由继续用更广泛的测序方案对更多患者进行测序,以提高我们做出新发现的能力。”(100yiyao.com 100医疗网)
参考文献:
Bastien Nguyen等人。Cell,2022,doi :10 . 1016/j . cell . 2022 . 01 . 003。
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