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两篇PLoS Biol论文鉴定了一种新的结核分枝杆菌抗生素耐药基因

来源:100医疗网原创2022-08-17 10336054

对来自23个国家的10,000多种不同结核分枝杆菌分离株的大规模分析揭示了与这种病原体对13种一线和二线新的和重复使用的抗生素的耐药性相关的新基因。

对来自23个国家的超过10,000种不同结核分枝杆菌菌株的大规模分析揭示了与这种病原体对13种一线和二线新的和重复使用的菌株的耐药性相关的新基因。这项研究由结核病综合耐药性预测国际联盟(Cryptic)进行,并在2022年8月9日发表在PLoS Biology上的两篇新文章中进行了描述。这两篇论文的标题分别是:对13种抗生素具有定量耐药表型的12,29个分枝杆菌分离株基因组的数据概要关联和全球结核分枝杆菌对10,228个基因组中13种抗生素耐药的全基因组关联研究发现了新的耐药机制。

结核病是一种可以治愈和治疗的疾病;85%的患者可以通过半年的药物治疗获得成功。尽管如此,近年来,结核病造成的死亡人数超过了其他传染病,而且耐药结核病是一个持续的威胁。更好地了解赋予抗生素耐药性的结核分枝杆菌变异体对于更好地监测耐药菌株和开发新药非常重要。

在第一篇新文章中,研究人员概述了他们如何将世界各地秘密合作伙伴实验室处理的12,289株结核分枝杆菌汇编成公开可用的数据。对每个分离株进行测序,然后在高通量网格上用13种不同浓度的抗菌剂进行测试。在列出的结核分枝杆菌分离株中,6814株分离株对至少一种药物耐药,包括4685株对多种药物或一线治疗药物利福平耐药的分离株。

在第二篇论文中,该联盟介绍了他们基于10228株结核分枝杆菌数据的全基因组关联研究的结果()。对于所有13种药物,他们发现未列出的变体与最小抑制浓度的显著增加有关,最小抑制浓度是防止结核分枝杆菌生长的抗生素的最低浓度。分析这种浓度,而不是简单地分析耐药性或非耐药性的结果,可以识别出仅引起抗生素反应轻微变化的变异体,这种变化可能通过增加药物剂量来克服。他们选择了对每种药物产生耐药性的20个最重要的基因,并更深入地描述了这些特定基因的影响和变化。

这些作者指出,我们的研究表明,全球合作有能力大大提高我们对结核分枝杆菌耐药性相关基因变异的理解。

这两篇论文不仅揭示了可以进一步了解结核分枝杆菌耐药性的特定基因,也为未来的病原体研究提供了框架。

这些作者说,这项研究不是为了测量流行率或估计耐药性预测工具的真实误差率而设计的;而是将其作为一种资源,通过丰富[全基因组测序]耐药性预测的突变目录,提高我们对耐药性遗传机制的理解,并确定重要的缺口和耐药模式,来加速抗生素耐药性诊断的发展。这项研究的数据是完全开源的,希望它能在未来几年促进和刺激未来的研究。(100yiyao.com)

参考资料:

德里克w克鲁克等人。《公共科学图书馆生物学》,2022年,doi :10.1371/journal . pbio . 3001321 . 3001320301

德里克w克鲁克等人。《公共科学图书馆生物学》,2022年,doi :10.1371/journal . pbio . 3001753536

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