研究和分析苹果中转座子插入调控的等位基因的特异性表达

来源：果树研究所2022-08-25 16:40

近日，中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队联合国内外科研机构，从全基因组水平阐释了苹果转座子(te)在调控等位基因特异表达(ASE)中的重要作用。

近日，中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队联合国内外科研机构，从全基因组水平阐释了苹果转座子(te)在调控等位基因特异表达(ASE)中的重要作用。相关研究成果发表于《植物生物技术杂志（Plant Biotechnology Journal）》。

转座子引起的遗传变异会导致物种表型多样性和生物进化，转座子在苹果基因组中的比例高达近60%。由于自交不亲和，苹果的基因组是高度杂合的，个体中存在大量的等位基因。然而，转座子插入对等位基因特异性表达的调控机制却知之甚少。

本研究以嘎拉苹果花培纯系为实验材料，进行了全基因组测序和组装。此外，使用皇家嘎拉花和果实的转录组测序数据，在整个基因组中鉴定了2091个等位基因。利用转座子对等位基因特异表达基因序列的分析表明，转座子被插入到苹果花色苷生物合成的转录因子MYB110a和MYB10的上游区域。通过对231份苹果种质的分析，发现两个MYB基因上游区域的转座子插入与等位基因特异性表达和花青素积累呈正相关，揭示了苹果颜色进化的基础。

该研究不仅从全基因组水平解释了转座子在调控等位基因特异性表达中的重要作用，也为在全基因组范围内快速鉴定植物中等位基因特异性表达基因及其调控元件提供了新方法。

本研究得到了国家自然科学基金和中国农业科学院农业科技创新项目的资助。

版权声明

本网站所有标注“来源：100医学网”或“来源：bioon”的文字、图片及音视频资料，版权归100医学网网站所有。未经授权，任何媒体、网站、个人不得转载，否则将追究法律责任。获得书面授权转载时，必须注明“来源：100医学网”。其他来源的文章均为转载文章。本网站所有转载文章都是为了传递更多信息。转载内容不代表本站立场。不想被转载的媒体或个人可以联系我们，我们会立即删除。

87%的用户都在使用100医疗网APP随时阅读、评论、分享、交流。请扫描二维码下载-