Nat Commun丨张勇与阮珏团队合作开发低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术LILAP

中国科学院动物研究所张勇研究组与中国农业科学院深圳农业基因组研究所阮珏研究组在Nature Communications杂志上在线发表了题为Low-input PacBio sequencing generates high-quality individual fly genomes and characterizes mutational processes的论文。该研究开发了一种基于Tn5转座酶的低DNA用量（100 ng）、无扩增、低成本的PacBio建库技术LILAP。团队利用该技术实现了两个单只雄性黑腹果蝇的全基因组测序和高质量组装，同时获得了内共生菌Wolbachia完整基因组，展示出LILAP的应用价值。基因组分析还发现了两个突变特性：复杂转座事件更倾向于发生在non-B DNA序列富集的区域；基因转换（gene conversion）事件使转座子同质化。