Sci Adv：核内RNA的时空定位：剪切效率的新视角

在真核细胞中有多种通过RNA和蛋白质相分离形成的无膜结构细胞器。它们在各种重要的生物过程， 包括核糖核蛋白复合物（ribonucleoprotein complex）的合成与组装，基因表达，信号传导，以及细胞应激反应中发挥着关键作用。核斑体（Nuclear speckles）是位于高等真核细胞核内的一种无膜结构细胞器，它富含参与mRNA剪接调控的蛋白因子和小核核糖核酸（snRNA），如U1、U2等，调控着共转录剪切过程。长期以来，核斑体被认为对mRNA剪接起到调控作用。然而，关于核斑体是否参与所有基因的剪切、哪些基因的剪切受其调控、以及核斑体如何识别并调控这些基因等基本问题，目前尚无明确答案。

来自芝加哥大学的费静怡课题组和纽约大学的Oded Regev研究团队合作，在Science Advances杂志上发表了题为Dynamic of RNA localization to nuclear speckles are connected to splicing efficiency的研究。作者利用ARTR-seq技术和成像技术定位了核斑体内的转录组；通过生化手段揭示了核斑体对于不同基因的剪切调控作用；并通过生信分析和建模方法揭示了和核斑体定位相关联的RNA序列特征。