Cell：初次发明针对III型CRISPR

2019年10月7日讯/BIOON/---假如说CRISPR复合物听起来很熟习，那是由于它们是新一波基因组编纂技巧的最前沿。CRISPR/Cas零碎是今朝发明存在于年夜多半与一切的古菌中的一种免疫零碎，被用来辨认和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的进攻零碎。

在CRISPR/Cas零碎中，CRISPR是纪律距离性成簇短回文反复序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeats）的简称，触及细菌基因组中的共同DNA区域，也是贮存病毒DNA片断从而许可细胞可以辨认任何试图再次沾染它的病毒的处所，CRISPR经转录发生的RNA序列（被称作crRNA）辨认入侵性病毒的物资。Cas是CRISPR相干卵白（CRISPR-associated proteins, Cas）的简称，Cas卵白像一把分子铰剪那样切割基因组上的靶DNA。迷信家们已发明他们可以应用CRISPR降解病毒RNA的自然才能，而且应用CRISPR零碎从简直任何一种无机体中移除不想要的基因。

古生菌和的CRISPR/Cas零碎维护它们的宿主免受噬菌体和其他的可挪动元件的影响。依据最新的分类尺度，CRISPR/Cas零碎可分为两年夜类：第1类CRISPR/Cas零碎和第2类CRISPR/Cas零碎。

第1类CRISPR/Cas零碎分为I型CRISPR/Cas零碎（标签基由于Cas3）、III型CRISPR/Cas零碎（标签基由于Cas10）和IV型CRISPR/Cas零碎（标签基由于Csf1）。I型CRISPR/Cas零碎可进一步分为I-A（标签基由于Cas8a, Cas5）、I-B（标签基由于Cas8b）、I-C（标签基由于Cas8c）、I-D（标签基由于Cas10d）、I-E（标签基由于Cse1, Cse2）、I-F（标签基由于Csy1, Csy2和Csy3）、I-U（标签基由于GSU0054）；III型CRISPR/Cas零碎可进一步分为III-A（标签基由于Csm2）、III-B（标签基由于Cmr5）、III-C（标签基由于Cas10或Csx11）、III-D（标签基由于Csx10）；IV型CRISPR/Cas零碎可进一步分为IV-A和IV-B。

第2类CRISPR/Cas零碎分为II型CRISPR/Cas零碎，它的标签基由于Cas9；V型CRISPR/Cas零碎，它的标签基由于Cas12a（之前称为Cpf1）、Cas12b（之前称为C2c1）和Cas12c（之前称为C2c3）；VI型CRISPR/Cas零碎，它的标签基由于Cas13a（之前称为C2c2）、Cas13b和Cas13c。II型CRISPR/Cas零碎可进一步分为II-A（标签基由于Csn2）、IIB（标签基由于Cas4）和IIC（不存在Csn2和Cas4），V型CRISPR/Cas零碎可进一步分为V-A（标签基由于Cas12a）、V-B（标签基由于Cas12b）、V-C（标签基由于Cas12c）和V-U（标签基由于TnpB-like）。VI型CRISPR/Cas零碎可进一步分为VI-A（标签基由于Cas13a）和VI-B（标签基由于Cas13b）。

在这些CRISPR/Cas零碎中，II型CRISPR/Cas零碎就复杂得多了，一个Cas9核酸酶应用导游RNA（gRNA）就可以完成辨认和切割靶双链DNA，是以II型零碎也被称作CRISPR/Cas9零碎。

在的免疫零碎中，CRISPR/Cas9的感化是靶向联合和摧毁侵入性的DNA，而且被作为一种稳健的基因组编纂技巧加以应用。噬菌体编码的小分子抗CRISPR卵白（anti-CRISPR proteins, Acr）可以让Cas9酶掉活，从而为基于Cas9的使用供给一种高效的封闭开关。

迄今为止，迷信家们已发明作为病毒-宿主军备比赛的一部门，病毒编码着I型CRISPR/Cas零碎、II型CRISPR/Cas零碎和V型CRISPR/Cas零碎的卵白克制剂，然则并不清晰能否存在着针对其他类型的CRISPR/Cas零碎的自然克制剂。

在一项新的研讨中，来自丹麦哥本哈根年夜学的研讨人员发明一种针对III型CRISPR/Cas零碎的克制剂--- AcrIIIB1，它是由硫化叶菌病毒（Sulfolobus virus）SIRV2编码的。AcrIIIB1仅克制由帮助卵白Csx1的RNase活性介导的III-B CRISPR/Cas免疫反响。相干研讨成果揭橥在2019年10月3日Cell期刊上，论文题目为“Inhibition of Type III CRISPR-Cas Immunity by an Archaeal Virus-Encoded Anti-CRISPR Protein”。