迷信家破译软籽石榴“突尼斯”基因组暗码

吃石榴不吐籽，软籽石榴做获得！但是，与硬籽石榴比拟，国际普遍栽培的软籽石榴“突尼斯”不抗冻的特色严重威逼和限制了家当安康成长。

近日，Plant Biotechnology Journal在线揭橥了中国农业迷信院郑州果树研讨所研讨员曹尚银课题组完成的软籽石榴“突尼斯”的高质量基因组图谱，为解析软籽和硬籽石榴种类分化遗传机制供给了支持，并为软籽石榴改进研讨奠基了主要根底。

石榴（Punica granatum L.）是一陈旧的落叶灌木果树树种，栽培汗青悠长。论文通信作者曹尚银告知《中国迷信报》，石榴被誉为“性命之果”，其果皮、果肉以及种子均含有丰厚的类黄酮、多酚、花青素等抗氧化物资，有利于预防高血脂、、HIV、沾染性疾病、冠芥蒂、前列腺癌症等疾病。尤其是软籽石榴种类，籽粒硬度小，食用时易于吞咽，防止了养分的流掉；此外，软籽石榴市场售价平日是通俗种类的2~4倍，是广阔果农脱贫致富的良果佳品。

论文第一作者骆翔博士引见，该研讨基于二代和三代测序取得了软籽石榴“突尼斯”高质量基因组序列，基因组年夜小为320.31 Mb，Contig N50为4.49 Mb，正文了33，594个基因。采取Hi-C光学技巧联合图谱将97.76%的序列组装到了8对染色体上。与现有的“泰山红”石榴基因组比拟，“突尼斯”多组装出了46.01Mb序列，Contig N50的均匀长度晋升了46倍，在组装完好度及准确度上都获得了极年夜地晋升。

比拟研讨标明，软籽“突尼斯”基因组和硬籽“泰山红”“年夜笨籽”基因组间存在着年夜量的SNP和InDel变异。对26个石榴种类停止群体学剖析标明，软籽石榴群体和硬籽石榴群体间存在着年夜量的受选择位点。尤其是Chr1上，存在着高达26.2Mb的受选择区段。基因正文信息标明，与基因组变异及选择旌旗灯号相干的基因潜在地影响着石榴硬籽和软籽特征分化。

本研讨获得了中国农业迷信院科技立异工程以及国度科技根底性任务专项重点项目标赞助。(100yiyao.com）