研讨提醒RNA甲基化调控R |
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R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA构成的特别核酸构造,在原核和真核生物的基因组平分布普遍且广泛存在。R-loop在好多症结的生物学进程中发扬主要功效,包含染色质润饰、转录调控、DNA毁伤修复以及基因组波动性等,但其若何被准确调控的机制尚不清晰。m6A润饰作为信使RNA上品貌最高的润饰类型,普遍介入哺乳植物的发育、免疫、更新、脂肪分化以及生成和转移等性命进程。但是,今朝尚不清晰m6A能否能作为R-loop中RNA组分的根源特点来调控R-loop程度,进而发扬各类生物学功效。
中国迷信院北京基因组研讨所杨运桂、任捷与清华年夜先生科院孙前文团队协作研讨,发明m6A能波动R-loop的构成,进而调控基因转录的无效终止。这一结果以m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination 为题于10月12日在线揭橥于《细胞研讨》(Cell Research)杂志。
研讨团队起首经过雀斑分子杂交和免疫荧光技巧,发明敲低m6A甲基转移酶METTL3明显下降R-loop程度,且该调控感化依附于METTL3甲基转移酶活性。随后,团队成员应用高效液相色谱结合质谱技巧,发明相较于染色体联合的RNA(caRNA),R-loop的RNA组分有加倍富集的m6A润饰。进一步应用基于单链DNA建库的DNA:RNA杂合链免疫共沉淀高通量测序技巧(ssDRIP-seq),发明下调的R-loop次要富集在转录终止区域,R-loop变更水平与m6A的间隔和润饰程度相干。为了摸索m6A对R-loop调控的生物学功效,研讨团队绘制了RNA聚合酶转录位点的高分辩率图谱,并在MYC、ACTIN基因长进行多种转录活性检测,发明m6A增进R-loop构成是转录终止阶段的症结步调,可以避免RNA聚合酶的转录通读。最初,团队成员构建了针对转录通读的申报基因零碎,经过m6A润饰位点的渐变进一步证明m6A关于R-loop构成及转录终止的症结感化。
该研讨发明了m6A甲基化润饰的共转录调控功效,提醒了RNA甲基化润饰对染色质构造的影响,以及R-loop构造中的RNA组分被润饰后对其本身稳态的调控机制,阐释了m6A经过波动R-loop而增进转录正常终止的景象,为进一步研讨m6A与R-loop的调控机制和响应生物学功效供给了根本的技巧和实际支持。(100yiyao.com)
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