Genome Biol:DNA决裂或会从新调理癌症基因的掌握机制 |
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2019年10月18日 讯 /BIOON/ --懂得介导癌症基因组中普遍DNA毁伤的机制不断以来都是癌症研讨人员十分感兴味的研讨范畴,近日,一项登载在国际杂志Genome Biology上的研讨申报中,来自贝勒医学院等机构的迷信家们经过研讨发明,基因组构造的变异或许能作为人类癌症中DNA甲基化改动(基因掌握的一种方式)的一种特别机制。
图片起源:NIH
文章中,研讨人员搜集了1400多团体类癌症的全基因组测序、基因表达和DNA甲基化数据,他们发明,构造变异会不时改动DNA的甲基化,从而影响数百个基因的表达,这从总体上下降了癌症DNA甲基化的全体程度。研讨者Chad Creighton传授说道,当基因组中一个部位的DNA片断挪动到另一个地位上时就会呈现基因组构造的变异,是以,当对DNA片断停止测序后研讨者就会发明来自两个DNA片断在基因组上会产生交融,这就会搅扰DNA编码的指令。
研讨者剖析了基因组构造变异对人类癌症中DNA甲基化和基因表达的影响,他们对人类癌症基因组图谱和全基因组胰腺癌剖析筹划中的数据停止剖析,这些数据包含贯串全部基因组的分子改动,即包含多种癌细胞中的卵白编码基因和调理区域,同时还以来自非癌变组织的雷同信息作为研讨对比。研讨者发明,在相当一部门癌症类型中,基因组构造变异在改动DNA甲基化上饰演着十分症结的脚色,DNA甲基化是一种能掌握基因表达的特别方法,同时其也是表不雅基因组的一部门,表不雅基因组触及对DNA的一切化学润饰,同时还与调理基因组中基因表达的卵白直接相干。
研讨者Creighton说道,在多种癌症类型中,甲基化的改动往往会以一种非随机的方法产生,这些基因中的一部门此前就发明与癌症有关,但研讨者还辨别出了一些此前以为与癌症并有关联的基因,一些基因能够会直接介入患者发病。总的来说,构造变异与DNA甲基化的全体程度降低有关。在癌症中,表不雅基因组会产生改动,而在以后研讨中,构造变异就是改动表不雅基因组的一种主要机制。研讨者以为,在分歧的癌症中,特定癌症中存在的构造变异数目是并不雷同的,一些癌症能够并不会产生很年夜改动,而有些癌症则会呈现普遍的构造变异,这就能协助研讨人员依据癌症的构造变异水平对其停止无效分类。
相干剖析还能为研讨者供给其它信息,比方研讨者就发明,携带高程度DNA改动的癌症往往趋势于免疫细胞的浸润程度降低,这关于癌症免疫疗法的开辟或许意义严重;本文研讨成果标明,构造变异不只在音符DNA序列毛病上饰演症结脚色,其还能在程度下影响DNA的表达,前期当研讨者寻觅癌症诱因时,他们或答应以思索一下构造变异对DNA甲基化的影响效应。(100医药网100yiyao.com)
原始出处:
Yiqun Zhang et al, , Genome Biology (2019). DOI:10.1186/s13059-019-1818-9
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