Elife：机械进修与表不雅遗传学药物发明

2019年10月24日 讯 /100医药网BIOON/ --跟着盘算机技巧的成长，机械进修弱小的处置数据的才能正在彻底改动我们的新药发明形式。近日，Sanford Burnham Prebys医学发明研讨所的迷信家开辟了一种机械进修算法，可以从显微镜图像中搜集信息，从而可以停止高通量表不雅遗传药物挑选，从而可以开拓针对癌症，心脏病，精力疾病等的新疗法。该研讨成果揭橥在比来的《eLife》杂志上。

文章作者，副传授Alexey Terskikh博士说：“为了辨认引诱表不雅遗传学感化的药物，迷信家须要挑选数十万种潜在化合物。我们的研讨则供给了一种弱小的基于图像的办法，可完成高通量表不雅遗传药物的发明。”

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表不雅遗传学是指DNA上的化学标签，经过调理基因的可接触性到达改动基因表达程度的目标。细胞的简直一切变更，包含对药物的反响和情况压力，都由其表不雅遗传形态反应出来。今朝美国食物药品监视治理局（FDA）曾经同意了几种靶向表不雅遗传学改动的癌症药物，此外，研讨人员正在尽力寻觅其他基于表不雅遗传学的医治办法。但是，因为缺少高通量的挑选办法，药物的开辟速度有所减慢。

在这项研讨中，迷信家经过剖析此前曾经被发明的超越220种已知在表不雅遗传学上起感化的药物，练习了一种机械进修算法。该办法可以检测活性药物，并经过其分子功效对化合物停止分类，整合多种细胞系和药物浓度的表不雅遗传变更特点，最终协助肯定未知化合物的任务方法。在该文章中，迷信家测验考试应用这种办法来判定用于医治角质细胞瘤（一种致命的脑癌）的表不雅遗传化合物。

Terskikh试验室的博士后研讨员，该研讨的第一作者Chen Farhy博士说：“我们的办法为开辟表不雅遗传学药物挑选供给了无效的平台。” “从事机制研讨的工业和学术研讨人员也可以从这种办法中受害，由于该算法可以检测并将分歧类型的表不雅遗传学变更特点停止分类。”

Terskikh和他的团队应用该算法研讨衰老细胞的表不雅遗传学变更，目标是开辟可以增进安康衰老的化合物。这项任务是与Sanford Burnham Prebys传授Peter Adams博士协作停止的。 Terskikh还盼望将技巧从2D图像扩大到3D视频，这将扩大该办法的功效。（100医药网100yiyao.com）

资讯出处：

原始出处：Chen Farhy, Santosh Hariharan, Jarkko Ylanko, Luis Orozco, Fu-Yue Zeng, Ian Pass, Fernando Ugarte, E Camilla Forsberg, Chun-Teng Huang, David W Andrews, Alexey V Terskikh. eLife, 2019; 8 DOI: 10.7554/eLife.49683