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古DNA提醒结核病若何塑造人类免疫体系

新冠肺炎(COVID-19)只是一种对人类生存发生了微小影响的新发沾染病。而一项新研讨应用前人类DNA提醒了在过来2000年里,结核病若何影响欧洲人,特殊是对人类基因组的影响。3月5日,相关论文登载于Cell Press细胞出书社旗下期刊American Journal of Human Genetics(《美国人类学杂志》)上。该论文不仅对退化遗传学研讨有意义,也对研讨学若何影响免疫体系有意义。

法国巴斯德研讨所的资深作者Lluis Quintana-Murci说:“本日的人类是那些打败了诸多难难幸存上去的人们的后辈,例如气候变动和年夜风行病,包含黑死病、西班牙流感和肺结核。这项任务应用了群体学来阐发自然选择是若何影响咱们基因组的。”

这项研讨的重点是TYK2基因的一个变种,被称为P1104A。该论文第一作者、巴黎年夜学影像研讨所疾病畛域博士生Gaspard Kerner之前发现,当该变种是纯合子时,它与感化结核分枝杆菌后患病的危险添加无关。(TYK2通过影响烦扰素旌旗灯号通路参加免疫功效。)Kerner开端与退化专家Quintana-Murci单干,在退化和自然选择的配景下研讨人类结核病的决议因素。

研讨职员应用一个包括1000多个欧洲前人类基因组的年夜型数据集发现,P1104A变异初次呈现于3万多年前。进一步阐发标明,这种变异的频率在年夜约2000年前急剧降低,这段光阴也年夜约是其时沾染性结核分枝杆菌开端风行的时期。该变异与其他感化性或病毒有关。

Kerner说:“要是你的基因组中携带了这种变异的两个拷贝,而且你遇到告终核分枝杆菌,你就很有能够会生病。在青铜期间,这种变异更为频仍,但咱们看到,跟着欧洲结核病风行,它开端被负选择。”(注:负选择是自然选择的一种模式,又称纯化选择。渐变的等位基因是无害的,在选择中处于优势,因而在群体中被镌汰。)

Quintana-Murci解释说:“这项任务的美好之处在于,咱们使用了群体学办法重修了一种风行病的汗青。咱们可以使用这些办法测验考试相识,在过来1万年里,哪些免疫基因变异添加最多,这就标明它们是最无益的,以及哪些因负选择削减最多。”

他弥补说,这类研讨可以弥补其他研讨,例如在试验室进行的研讨。此外,两位研讨职员都表现,这些对象可以用来研讨多种沾染病的许多分歧基因变异的汗青和影响。

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This work was supported by the Institut Pasteur, the College de France, the Centre Nationale de la Recherche Scientifique (CNRS), the Agence Nationale de la Recherche (ANR), the French Government"大众s Investissement d"大众Avenir program, Laboratoires d"大众Excellence "大众Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases"大众 and "大众Milieu Interieur,"大众, the Fondation pour la Recherche Medicale, the Fondation Allianz-Institut de France, and the Fondation de France. Kerner was supported by the Imagine Institute with the grant 公众Imagine Thesis Award."大众

American Journal of Human Genetics, 作者Kerner等: 公众Human ancient DNA analyses reveal the high burden of tuberculosis in Europeans over the last 2,000 years"大众

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Gaspard Kerner

巴斯德研讨所

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