研讨提醒木薯单体型基因组退化及功效分解纪律

近日，中国热科院生物所和品资所结合福建农林年夜学、伊利诺伊年夜学、华中科技年夜学、中国农业迷信院、哥伦比亚年夜学等13家单元，绘制了木薯栽培种类SC205（华南205）高质量参考基因组和单体型基因组图谱，提醒了等位基因表白分解纪律及其对木薯紧张性状的影响，以及基因组高杂合的退化驱能源等紧张迷信成绩，为木薯改进奠基了紧张实际根底。相关研讨结果在线颁发在中科院JCR一区TOP期刊《Molecular Plant》（IF=12.08）。

木薯是天下紧张的食粮作物和动力作物，为105个国度近10亿生齿提供碳水化合物起源。木薯基因组（2n = 36）具备高度杂合特征，使其成为研讨等位基因分解的优越体系。今朝，年夜多半参考基因组为单倍型镶嵌组装，限定了对基因组中等位基因变异的功效研讨和育种应用。该研讨针对木薯高杂合性的遗传根底及其退化驱能源，依托中国热科院寒带生物组学中间平台，得到了以下三方面研讨成果：一是应用PacBio单分子测序和Hi-C技术绘制了木薯栽培种类SC205参考基因组图谱，Scaffold N50 到达34.5 Mb，正文了37923个基因，进一步构建了18对同源染色体高质量单体型基因组图谱，鉴定了24128个双等位基因（Bialleles）；二是通过转录组阐发发现双等位基因间普遍产生表白不屈衡，且淀粉和蔗糖代谢路径上的双等位基因表示出显着的表白分解；三是等位基因组退化阐发提醒了基因组疾速退化能够是木薯高杂合性造成的紧张驱能源，且基因组偏向性选择驱动等位基因表白分解。该研讨深入了对木薯双等位基因变异根底的懂得，为应用双等位基因立异木薯和其他高杂单干物育种战略提供了新见解。(100yiyao.com）