余学清/张镇海/曹广文团队结合提醒人抗体组库的症结特征

广东省人平易近病院余学清团队、北方医科年夜学张镇海团队以及中国人平易近束缚军水师军医年夜学曹广文团队结合在线颁发了群体程度下人抗体组库特征谱的研讨，提醒了包含基因使用率、基因重组偏好、公共克隆以及体细胞超渐变在内的多个抗体组库的症结特征。

国内学术期刊《细胞申报》在线颁发了这一研讨结果，博士生杨修佳为第一作者。

抗体组库（Antibody repertoire）是指某一特定个别或组织所包括的全体抗体的聚拢，它是人类顺应性免疫体系的紧张构成部门。抗体的多样性源于多个机制，包含生殖系基因片断的重组、连贯位点的修饰、体细胞超渐变以及重轻链配平等。据估量，这些机制可以发生至多1012种分歧的抗体，是以，多样化的抗体可能特同性地辨认简直是有限的潜在免疫原。

晚期的技术（即Sanger测序和谱型阐发）因为通量小或分辩率低，极年夜地限定了对立体组库的研讨。然而，高通量测序的呈现使人们可能以单个核苷酸的高分辩率同时对数以百万计的抗体进行深化细心的研讨，这一技术被称为抗体组库测序（Ig-seq）。抗体组库测序的呈现极年夜地匆匆进了咱们对体液免疫的懂得，今朝抗体组库测序的利用已在过敏反馈、炎症反馈、沾染病、、抗体发现以及疫苗挑选等畛域取得了紧张停顿。特殊地，在环球新冠病毒年夜风行时代，抗体组库测序还被胜利地用于新冠病毒感化患者体液免疫动静变动的监督以及针对新冠病毒的中和抗体的挑选。

鉴于其微小的后劲，研讨者们依据特定的研讨目标，临盆了一批又一批的抗体组库测序数据。然而，因为其难以估计的多样性，单个研讨所使用的样本的代表性相称无限。此外，分歧的研讨通常使用分歧的阐发流程，这使得分歧的研讨之间的成果难以互相比拟。是以，基于的抗体组库特征描写显得尤为紧张。

在张镇海传授的指导下，博士研讨生杨修佳、张艳芳、朱燕以及硕士研讨生曽惠昆等搜集了2，152套高质量的抗体重链测序数据集，并对包含基因使用率、基因重组偏好、公共克隆以及体细胞超渐变在内的多个抗体组库症结特征进行了深化粗疏的阐发。该团队发现：52个焦点V基因参加了超过99%的抗体的重组；V基因重组在染色体上同时具备近端和远真个地位偏好性；人与人之间童稚B细胞抗体组库的类似性在取样不敷的环境下能够会被低估；RGYW相关的体细胞超渐变（Somatic hypermutations，SHMs）倾向于被阳性选择。以上这些研讨结果为抗体组库研讨提供了紧张的基线（baseline）参考。

基于上述52个焦点V基因的发现，该团队进一步的研讨标明，此中26个V基因的使用在安康人和非安康人之间有显着的差异。例如，在非安康人中，IGHV4-34、IGHV4-39和IGHV4-59被下调，而IGHV1-18、IGHV1-69和IGHV3-11被上调，这一成果暗示可依据V基因的使用率来区分个别的免疫状态。紧接着该团队应用机械培训的办法以V基因的使用率作为输出，比拟了包含该研讨所界说的52个焦点V基因在内的三个V基因聚拢在区分安康和非安康个别时的性能表示，成果标明该研讨所界说的52个焦点V基因集预测性能更优（AC=0.686，AUC=0.763）。是以，这一成果不仅证实了应用抗体组库特征对个别的安康状态进行分类的可行性，还标明了该研讨所界说的52个焦点V基因集是一个更好的预测器（predictor）。

另外，值得注意的是，该团队在体细胞超渐变的阐发中，将V基因生殖系序列上的每个位点依照渐变的效果（即错义渐变或同义渐变）进行分类，从而提醒了RGYW模体在体细胞超渐变中的阳性选择征象。这一研讨结果标明靶向分歧渐变热门位点对立体亲和力成熟能够会带来分歧的影响，从而对疫苗的设计和选择提供紧张指导。

“人类抗体组库极端多样。与之前的研讨相比，咱们所阐发的样本数目尽管有了显着的提升，但还远远不敷以捕获到抗体组库一切的多样性。此外，为了更好地舆崩溃液免疫，咱们还必要更为普遍的疾病状态下以及分歧亚型和组织类型的抗体组库数据集。与其他名目相比（如TCGA），今朝的数据集相称无限。想要充沛开释抗体组库测序利用的后劲，将来还必要更多在分歧心理前提和烦扰下的样本数据集。”该文的第一作者杨修佳评论道。(100yiyao.com）