研讨宣布恒河猴参考基因构造 提醒人类转录本演变新机制

作为人类近缘的非人灵长类形式植物，恒河猴在脑迷信、分子演变、药物研发等根底与转化研讨中发扬着不行替代的作用。然而，今朝恒河猴基因构造次要源于预测，重大制约了该特点模子在分子程度的研讨与利用。

近日，北京年夜学分子医学研讨所李川昀传授课题组运用全长转录本测序技术，开辟了新办法，从新精确界说了恒河猴全长基因构造，并以此为根底探求了多聚腺苷酸化（polyadenylation）调控纪律及其在人类转录本演变中的作用。题为“Polyadenylation-related isoform switching in human evolution revealed by full-length transcript structure”的研讨论文在期刊Briefings in Bioinformatics颁发。

在真核生物中，基因通过转录造成mRNA并执行生物学功效。在这个进程中，统一个基因通过剪接等方式去除某些基因片断，从而造成分歧的异构体。传统的二代测序技术因为读长较短，难以从整体程度对基因异构体进行准确界说。这项任务通过对恒河猴年夜脑、心脏、小脑和睾丸4个组织进行基于第三代测序技术的全长转录组研讨，获得了800万条均匀长度超过14K的测序读段，并联合传统的短读长数据，完成了对51605恒河猴全长基因构造的准确界说。

借助上述精准的恒河猴基因构造，本研讨进一步对人类多聚腺苷酸化（多聚腺苷酸化是发生成熟mRNA的紧张步调）介导的基因异构体进行了探求：基于全长转录组测序数据，以恒河猴和小鼠作为外类群，鉴定获得79团体类早先来源的远端多聚腺苷酸化位点。群体学研讨进一步标明，由这些远端位点所发生的人类特异异构体遭到自然选择约束，提示它们已具有了生物学功效。进一步的研讨发现，它们可通过与出核和调控等机制互作，完成对基因表白的准确时空调控。

李川昀课题组近年来运用恒河猴作为人类近缘形式植物的劣势，在提醒根本调控的演变纪律、探求人类特有性状的分子根底中取得系列结果(Genome Biol.， 2019； PNAS， 2018； Nat Comm.， 2018， 2020； Circ Res.， 2019； PLOS Genet.， 2012， 2014， 2015； MolBiol and Evol.， 2014， 2015， 2016， 2017； Nuc Acids Res.， 2013，2017)。本研讨作为该系列任务的一部门，所界说的恒河猴参考基因构造将显着匆匆进以恒河猴为特点模子的根底与转化研讨，并为终极懂得“人之以是为人”的物资根底提供新角度。(100yiyao.com）