Nature:迷信家胜利绘制出小鼠年夜脑中数百万个细胞的完全图谱! |
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起源:本站原创 2021-10-14 00:17
来自加州理工学院等机构的迷信家们通过研讨以一种史无前例的分辩率描写了小鼠年夜脑中的巨大基因组细节,以及若何联合多品种型的基因组学技术来完成这一阐发。2021年10月14日 讯 /100医药网BIOON/ --全长的SMART-seq单细胞RNA测序能用于测定基因在同源异构体分辩率下的表白,从而就为辨认出分歧细胞类型的特定同位素标志成为能够,与空间RNA捕捉和基因标志办法联合使用就能使得对分歧细胞类型的空间解析同源异构体表白的揣摸成为能够。构建简单的人类年夜脑以及年夜约1000亿个独自的神经元图谱并不是一件容易的事情;作为应答这一微小挑战的“前奏”,研讨职员曾经从对小鼠年夜脑的研讨来懂得年夜脑中分歧的细胞类型以及其之间的联系关系,并能通过欠缺技术办法来完成这一目的。
图片起源:https://www.nature.com/articles/s41586-021-03969-3
近日,一篇颁发在国内杂志Nature上题为“Isoform cell-type specificity in the mouse primary motor cortex”的研讨申报中,来自加州理工学院等机构的迷信家们通过研讨以一种史无前例的分辩率描写了小鼠年夜脑中的巨大基因组细节,以及若何联合多品种型的基因组学技术来完成这一阐发。
该研讨是一项名为“通过推动立异性神经技术从而进行年夜脑研讨”倡导筹划(BRAIN筹划)的一部门,该筹划由美国NIH提供赞助。这篇研讨申报中,研讨职员重点对小鼠的年夜脑低级活动皮层进行研讨,其是节制小鼠机体活动的症结区域。研讨者Booeshaghi等人阐发了所搜集的来自卑脑细胞的基因组互相数据,并通过联合三种分歧的试验性技术(每种技术都有本人的劣势和优势),研讨职员就能具体阐发小鼠年夜脑皮层中脑细胞中的基因表白环境,这些技术的组合能以一种超出其各部门之和的方式发扬了单个技术的劣势。
这张信息图描写了在这项新任务中联合的三种技术,以及这种联合若何发生对于脑细胞中基因表白的
多维信息。
图片起源:A.S.Booeshaghi
该研讨通过所谓的基因同源异构体完成了细化的程度,为了懂得该异构体,研讨职员就十分有需要懂得构成基因的单个RNA转录物的表白环境;基因表白是DNA被转录成为RNA,以及随后RNA被分子机械翻译为卵白质的进程;诸如在人类等低等真核生物中,这种信息流包含一种称之为“剪接”(splicing)的进程,在这一进程中,RNA会被切碎,一些碎片在转酿成为卵白质之前又会被粘在一路,这种切割和粘贴的进程就发生了统一基因的多种口胃的“转录本”:异构体,这些异构体能被转化为具备分歧功效的卵白质。
通过火析诸如斯类异构体,研讨职员就发现,渐变体是招致脑细胞之间功效性差别的一个症结方面,而对异构体的阐发关于年夜脑尤其紧张,剪接进程在年夜脑组织中处于高度沉闷状态,并且好多神经性疾病都是因剪接进程的中止会引发。综上,本文研讨成果标明,同源异构体或者有助于细胞细胞的分类,并且应用多种丈量办法来对单细胞转录组学数据进行多平台的阐发或能提供小鼠低级活动皮层转录的完全图谱,从而或能改善任何繁多技术所提供的能够性。(100医药网100yiyao.com)
原始出处:
Booeshaghi, A.S., Yao, Z., van Velthoven, C. et al. . Nature 598, 195–199 (2021). doi:10.1038/s41586-021-03969-3
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