自然通讯:研究揭示了脊髓室管膜瘤的微环境和各种细胞的相互作用网络 |
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资料来源:生物物理研究所,2021-02 08:16
室管膜瘤是一种发生在儿童和成人中枢神经系统的神经上皮恶性肿瘤。常见于幕上、后颅窝和脊髓。大脑中的室管膜瘤主要发生在儿童,与此不同,脊髓中的室管膜瘤在成人中更为常见。手术切除是目前脊柱室管膜瘤的主要治疗方法,但并非所有患者都具备全切除的条件。对于不接受辅助放疗的患者,肿瘤复发率高达50%-70%。因此,发现新的治疗靶点和策略对临床室管膜非常重要。
室管膜瘤是一种发生在儿童和成人中枢神经系统的神经上皮恶性肿瘤。常见于幕上、后颅窝和脊髓。大脑中的室管膜瘤主要发生在儿童,与此不同,脊髓中的室管膜瘤在成人中更为常见。手术切除是目前脊柱室管膜瘤的主要治疗方法,但并非所有患者都具备全切除的条件。对于未接受辅助放疗的二次切除患者,复发率高达50%-70%。因此,寻找新的治疗靶点和策略对临床室管膜瘤的治疗具有重要意义。
近日,北京师范大学教授贾尼斯与中国科学院生物物理研究所研究员、北京天坛医院院长贾联手。《自然通讯》上发表了一篇题为“脊柱室管膜中微环境景观的询问恢复了肿瘤相关宏观结构的双重功能”的研究论文。本工作从单细胞水平系统研究了脊髓室管膜瘤中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞,揭示了肿瘤微环境的细胞群和基因表达谱,深入分析了相关巨噬细胞亚群的分子特征、谱系转化特征以及这些免疫细胞与其他细胞的相互作用。
近十年来,单细胞水平、转录组学和表观遗传学技术被广泛用于研究肿瘤细胞和肿瘤微环境的异质性,但对成人脊柱室管膜瘤尤其是室管膜瘤的细胞组成和微环境特征的研究非常有限。本文对3种不同恶性程度的脊髓室管膜瘤,即室管膜下瘤(SE)、室管膜瘤(EPN)和间变性室管膜瘤(AEP)进行了多组学测序和分析,包括单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq和H3K4me3/H3K27ac ChIP-seq,获得了脊髓室管膜瘤恶性细胞和微环境的细胞图谱和表观信息。
该研究主要关注肿瘤相关巨噬细胞不同亚组的基因表达特征和功能。发现5个TAM亚组中,CCL2与免疫反应有关,而CD44亚组与肿瘤血管生成有关,分别起到“抗肿瘤”和“促进”的作用。结合scRNA-seqhe scATAC-seq分析,揭示TEAD1和EGR3可能是调控上述两种TAM双重功能的关键转录因子。此外,通过对TAM的谱系研究,研究者发现CD44亚群可能有两个来源,即组织驻留的CX3CR1 TAM亚群和组织侵袭的CD14单核细胞,而CCL2亚群仅来自CX3CR1 TAM亚群。
虽然巨噬细胞是一种在肿瘤中被广泛研究的细胞类型,但在巨噬细胞自身特性研究的基础上,对脊髓室管膜瘤微环境中不同TAM亚群的相互作用进行了深入研究。研究发现,CD44 TAM亚群在肿瘤微环境中与内皮细胞、成纤维细胞和周皮细胞有更强的细胞间通讯,揭示CD44 TAM亚群可能在内皮细胞作为中介的帮助下,积极参与肿瘤血管生成,促进肿瘤发生发展。CCL2 TAM亚群更倾向于与T细胞等免疫细胞相互作用,参与肿瘤免疫反应,抵抗肿瘤发展。此外,本研究还鉴定了不同类型脊髓室管膜瘤中的恶性肿瘤细胞,并在每种肿瘤类型中鉴定了5-10种恶性细胞亚群。通过比较三种类型肿瘤中恶性细胞的基因表达谱,发现内皮-间充质转换(EMT)通路在恶性程度较高的AEP型和EPN型肿瘤中可能更为活跃。多组学数据的进一步联合分析表明,CDH6基因可能在EMT中起重要作用。该研究还预测了恶性细胞亚群特征基因的药物靶点,为靶向治疗提供了参考数据。(100yiyao.com)
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