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Nat Genet:对2658个肿瘤样本的分析揭示了导致癌症的新突变

来源:原创网站2022-02-13 00:16

来自Francis Crick Institute等机构的科学家通过研究发现,21%的肿瘤携带双突变,即你身体的DNA在母体和拷贝中都有碱基相同的突变,这是以前分析肿瘤时没有考虑到的观察结果,但对于未来的癌症研究非常重要,因为研究人员可以阐明突变在癌症发生过程中的起源和生物学意义。

2022年2月13日/100医学网bion/-分子进化的无限位点模型认为基因组中每个位点最多会有一个突变;通过限制可能的突变历史、单倍型和等位基因数量,可以形成肿瘤系统学分析的基石,这在调用、分期和解释突变体或研究整个突变景观时经常被暗示。近日,国际期刊《自然遗传学》(Nature Genetics)发表题为《癌症基因组中的双等位基因突变揭示局部突变决定因素》的研究报告,来自弗朗西斯克里克研究所等机构的科学家通过研究发现,21%的肿瘤携带双突变,即你身体的DNA在母体和拷贝中都有相同的碱基突变。这是以前在分析肿瘤时没有考虑到的观察结果,但对于未来的癌症研究非常重要,因为研究人员可以阐明癌症发生过程中突变的起源和生物学意义。

图片:Pixabay/CC0公共域

我们身体的DNA被认为是一本很大的食谱,里面只写了四个不同的字母,即A、T、C、G四个碱基,大约包含30亿个字符,所以你可以把人体的DNA比作大约3000本食谱。细胞每分裂一次,身体的整个DNA就会复制过去。在复制3000个食谱的过程中,可能会出现一些错误,即细胞可以转化为癌细胞的突变。当然,这并非不可思议。

不过幸运的是,人体内的大多数细胞都有两份食谱,一份来自母亲,一份来自父亲,这意味着所有的食谱仍然可以轻松阅读,即使有错误悄悄进入它们,也不会影响它们。从统计学上讲,细胞每次分裂时,在两个食谱中出现完全相同的错误字符是非常不可能的。因为字母在DNA中以这种方式被扭曲的可能性很小,基因研究认为这种情况可能根本不会发生,所以我们DNA中的字母只会改变一次;在这篇文章中,研究人员在一项大规模研究中指出,这一假设(至少对癌细胞而言)是不正确的。

在这篇论文中,研究人员分析了来自38种不同类型肿瘤的2658个完整的DNA序列,在高达21%的病例中发现了这种双突变。虽然从统计学上讲,男性和女性拷贝中相同字母突变的概率很小,但在研究的五种肿瘤中有一例。研究员德穆莱米斯特说,这个数字可能太大了,不可能是巧合。我们发现,例如,在皮肤癌中,一些DNA片段可能比其他片段对紫外线造成的损伤更敏感。这可以解释一些双重打击,对细胞没有明显影响。这些信息对于发现有助于形成癌细胞的突变非常重要,因此它可能是科学家开发新疗法的一个很好的目标。

图片:https://www.nature.com/articles/s41588-021-01005-8

目前,研究人员Demeulemeester和他的同事正在努力开发新的计算机算法,以便其他科学家也可以检测和研究这些双突变。到目前为止,这些双突变一直被忽视或被认为是“技术错误”,这就是为什么它们没有被纳入癌症遗传学的研究和分析,因为它们真的非常重要,研究人员需要开发方法来检测它们并将其考虑在内。综上所述,本文的研究成果突出了开发精确的模型来预测突变率、肿瘤演变和从测序数据进行推断的重要性和必要性。(100yiyao.com 100医疗网)

原始来源:

Demeulemeester,j .Dentro,S.C .Gerstung,m .等.Nat Genet (2022年)。doi:10.1038/s 14588-021-01005-8

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