Nucleic Acids Research：提出从头合成型病毒RdRP引发RNA合成的诱导符合机制

起源：武汉病毒所 2021-08-18 07:51

RNA病毒转录及基因组复制进程均不波及DNA模式，必要由病毒本身编码的依赖RNA的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRP）来主导实现。RdRP在特定位点精准而高效地引发聚合反馈对维持病毒基因组的完全性及合成正确的转录产品至关紧张。依据引发方式的分歧，RdRP可分为依赖引物（primer-dependent）型和从头合

RNA病毒转录及基因组复制进程均不波及DNA模式，必要由病毒本身编码的依赖RNA的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRP）来主导实现。RdRP在特定位点精准而高效地引发聚合反馈对维持病毒基因组的完全性及合成正确的转录产品至关紧张。依据引发方式的分歧，RdRP可分为依赖引物（primer-dependent）型和从头合成（de novo）型，后者通常由位于拇指构造域内的“引发元件”（priming element，PE）辅助RdRP完成精准高效引发。然而，分歧科属病毒的RdRP的引发元件在氨基酸序列和三维构造上表示出较高的多样性，已有研讨未能用普适的机制来阐释这类RdRP的引发进程。

中国迷信院武汉病毒研讨所研讨员龚鹏团队致力于病毒RdRP的催化与调控机制研讨。近日，科研团队解析了一个分辩率为3.1埃的经典猪瘟病毒（classical swine fever virus，CSFV）RdRP的晶体构造（图1，PDB号：7EKJ），该构造初次展现了同属病毒RdRP引发元件较为完全的构造信息，而构造阐发标明该引发元件与引发位点间隔较远（达9埃左右），必要阅历变构方可完成引发。该团队应用酶学办法进一步发现引发元件中一个激进的甘氨酸残基G671对引发反馈有紧张奉献。与家养型（WT）RdRP相比，该位点的渐变卵白的引发效率显明下降，此中影响最年夜的G671P渐变体的引发速度常数kcat值下降约7倍（图2）。同时，通过对C端分歧长度的截短RdRP的表征，发现引发元件尾部665-680区域在RdRP的引发进程中发扬紧张作用。联合在CSFV的同科病毒丙型肝炎病毒（hepatitis C virus，HCV）和登革病毒（dengue virus，DENV）中的比拟性研讨，该团队据此提出RdRP的引发元件在RdRP与模板RNA及NTP底物联合时，可通过“诱导符合”方式变构而完成引发，进而通过查询拜访代表性从头合成型RdRP的引发元件的构造和序列特征提出这一机制或具备普适性（图3）。该研讨为全面深化懂得病毒RdRP引发机制提供了紧张根据。(100yiyao.com）

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