CstF64 诱导的 BID 3'UTR 延长通过毁坏与 ZFP36L2 的 ceRNA 串扰来匆匆进食管鳞状细胞癌的停顿 |
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替代聚腺苷酸化 (APA) 是一种 RNA 加工变乱,许可 RNA 聚合酶 II 终止产生在分歧的地位,从而发生分歧的 3"大众-末尾。近 70% 的人类基因具备不止一个多聚腺苷酸化位点 (PAS),标明 APA 是推进转录组多样性的次要引擎。尽管有一部门APA产生改动卵白质c端编码潜能,但年夜多半APA变乱招致3公众UTR长度和含量的改动。尽管编码序列(CDS)没有改动,但通过3"大众UTR长度的调理,APA的影响是深远的,由于它可以影响mRNA的稳定性、mRNA的翻译、mRNA的定位和卵白质的定位。此外,APA还可以改动的途径,招致许多不受APA影响的基因表白改动。
APA的紧张性才刚刚开端被意识到,并已被发现波及多种生物进程和疾病状态。普通察看,3’utr在发育和细胞分解进程中呈进行性缩短,而在增殖细胞中呈普遍延长。APA调控失调通过渐变或种系变异招致人类疾病,这些渐变或种系变异发明/毁坏特定的PASs,或通过APA调控因子表白的改动招致PAS用法的更普遍变动。
在这些疾病状态中,发现癌症对3"大众UTR状态高度敏感,在肿瘤中察看到绝对于正常组织的延长。占劣势的概念是,内3"大众UTR延长是通过失去对miRNA的克制而激活癌基因的机制。此外,作者和其别人曾经证实,宽的3公众UTR延长可以毁坏竞争的内源性RNA (ceRNA)网络,从而通过miRNA的开释和靶向加强克制克制基因。综上所述,这些研讨标明3"大众UTR延长能够通过多种机制以顺式、反式或结合方式匆匆进产生,并强调了APA调控基因表白的简单性。
食管癌灭亡率在环球排名第六,在中国尤其重大,它是癌症相关灭亡的第四年夜起因。食管鳞状细胞癌(ESCC)和食管腺癌(EAC)是两种次要的组织学亚型。在中国如许的高危地域,食管癌占食管癌病例的90%以上。通过对ESCC、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)和肺鳞状细胞癌(LUSC)基因表白的单核苷酸变异(SNVs)和拷贝数变异(CNVs)阐发,发现ESCC与EAC之间存在类似的基因表白谱和形式。这进一步支持了ESCC作为鳞状亚型的特征,提示ESCC、HNSC和LUSC能够具备某些独特的致瘤机制和分子特征。
虽然新的证据显示APA在产生中起着症结作用,但APA在ESCC中的紧张性尚未获得很好的描写。在之前的任务中,作者使用全基因组测序(WGS)和高妙度RNA-seq阐发了94例ESCC患者的配对肿瘤和非组织,并申报了这些中国ESCC患者的基因组改动(包含SNVs、CNVs和构造变异(SVs))的综合阐发。BRCA1相关卵白(BRAP)和t诱导的糖酵解和凋亡调理卵白(TIGAR)在ESCC中因为拷贝数添加而适度表白,并已被证实与ESCC停顿或化疗耐药无关。该数据集为进一步研讨ESCC中的分子标志提供了一个弱小的资本。
ESCC增殖中bbid 3公众UTR异常延长的模子。
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总而言之,该数据提醒了scc中BID 3"大众UTR的周期性延长,以及先前未确认的连贯BID和ZFP36L2 3"大众UTR的ceRNA网络。在ESCC停顿进程中,作者以为BID 3"大众UTR的延长招致BID的上和谐ZFP36L2的下调。BID的3"大众UTR的缺失通过烦扰BID与ZFP36L2的ceRNA穿插,匆匆进ESCC细胞的增殖活性。此外,该研讨发现,ESCC患者的低生活期与BID的3"大众UTR延长或ZFP36L2下调之间存在显著相关性。
尽管 CstF64 的适度表白是 BID 3"大众UTR 延长的部门起因,但决议 BID PAS 选择的整套因素仍未确定,能够代表新的医治靶点。总之,该研讨初次提供了证据,证实3"大众UTR延长BID和ZFP36L2下调是scc中广泛存在的征象,并能够作为ESCC的预后标记物和医治靶点。( 100yiyao.com)
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