基因组生物学:杨建华/曲良虎团队发现p53调控的lncRNA编码的多肽在癌细胞增殖中的作用

来源：生物世界2022-11-07 15336006

本研究利用多组学技术发现了一组由长链非编码RNA(lncRNA)编码的多肽是p53信号通路的新成员，并揭示了这些多肽在p53信号通路中的功能和调控网络。

TP53(p53)是最重要的肿瘤抑制因子，对维持细胞基因组的完整性至关重要。为了应对DNA损伤，p53蛋白被激活并作为转录因子来调节大量蛋白质编码基因、mirna和长链非编码RNA(lncRNA)的表达。在前期研究中，我们发现了p53调控的LTR反转录转座子衍生的lncRNA(LTR-lncRNA)促进DNA同源重组和修复的新功能。

有趣的是，最近的研究发现，一些lncRNA可以进一步编码肽(小肽)在重要的生理和病理过程中发挥调节作用。然而，p53调控的lncRNA能否编码多肽并作为多肽发挥重要的生物学功能仍有待阐明。

最近，中山大学生命科学学院杨建华教授/曲良虎教授研究组在《基因组生物学杂志》上发表了一篇题为：TP53-工业上推定的长非编码RNAs编码抑制细胞增殖的功能多肽s的研究论文。

本研究利用多组学技术发现了一组由长链非编码RNA(lncRNA)编码的多肽是p53信号通路的新成员，并揭示了这些多肽在p53信号通路中的功能和调控网络。

研究团队通过构建DNA损伤修复细胞模型，结合Ribo-seq、RNA-seq、CRISPR/Cas9和RNA组学分析，系统鉴定了人类细胞中受p53调控的300多个lncRNA和200多个具有编码潜力的lncRNA(图1)。

图1:通过联合蛋白质组学技术鉴定p53调节的具有编码潜力的lncRNA

本研究随机选取一批lncRNA进行实验验证，确认了p53调控的lncRNA编码的15种多肽。此外，通过使用各种质谱技术(鸟枪法MS、PRM MS和MRM MS)和抗体制备技术，发现许多多肽在人类细胞中内源性表达。

进一步的功能丧失和获得实验表明，p53调控的TP53LC02和TP53LC04多肽可以抑制多种癌细胞的增殖，并且多肽分子代替lncRNA分子发挥作用。本研究还证明了TP53LC04多肽可以通过调节细胞周期参与p53介导的肿瘤抑制。这项研究揭示了lncRNA编码的多肽在p53调控网络中的新作用(图2)，扩大了人们对p53调控网络的了解，并为有效的癌症治疗提供了新的潜在靶点。

图2:2:p53调节的lncRNA编码的多肽在癌细胞增殖中的功能

杨建华教授、曲良虎教授、特聘副教授、暨南大学何清玉教授为论文合著者，许、博士、博士、妙林法师彭辉为论文合著者。本研究得到了国家重点科技攻关项目的资助。d计划和其他国家项目。

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