Nat Immunol：判定出对立特别靶标的T细胞

2019年11月21日 讯 /100医药网BIOON/ --当接种疫苗，或许解除过敏原以及微生物病原体之后，免疫零碎激活，发生的T细胞亚群将辨认并肃清“外来入侵者”。这些T细胞中的一些被可以立刻发扬感化，而另一些则成长为“记忆T细胞”，全身轮回的同时维护宿主免受入侵者再次呈现的袭击。现在，麻省理工学院的研讨人员如今曾经设计出一种办法，以判定具有特定靶标的T细胞，经过高通量单细胞RNA测序，作者可以肯定某一细胞在给准时间的基因表达情形，进而提醒T细胞的共同功效。在这项新研讨中，研讨人员应用该技巧判定了发生花生过敏患者中特殊的炎性T细胞。

（图片起源：Www.pixabay.com）研讨人员经过应用这种办法来研讨患者的T细胞对花生过敏的特点，进而可以协助开辟特定疗法并肯定该疗法能否对特定患者无效。此类研讨还可以协助指点研讨人员开辟和测试新疗法。相干成果近日揭橥在《Nature Immunology》杂志上。该论文的次要作者是研讨生Ang Andy Tu和博士后Todd Gierahn。研讨人员的新办法树立在他们先前的任务开辟的技巧之上，该技巧可以在年夜量细胞上疾速履行单细胞RNA测序。经过对信使RNA停止测序，迷信家可以发明在给准时间表达的基因，从而使他们懂得单个细胞的功效。在T细胞等免疫细胞长进行RNA测序十分令人感兴味，由于T细胞在免疫反响中具有很多分歧的感化。但是，以前的测序研讨无法准确找到对特定靶标或抗原有反响的T细胞群体。这是由T细胞受体（TCR）的序列特点决议的。单细胞RNA测序平日仅标志和测序每个RNA分子的个中一端，而T细胞受体基因的年夜部门变异都位于序列的另一端，因此惯例测序手腕无法辨认这些差别。“很长一段工夫以来，人们不断在用这种传统的办法剖析T细胞及其转录组特点，但无法肯定T细胞的受体信息。”在单个T细胞中，编码T细胞受体的RNA缺乏细胞总RNA的1％，是以MIT小组提出了一种扩增这些特定RNA分子，然后将其从总样品中“拉出”的办法。每个RNA分子都标志有条形码，以提醒其细胞起源信息，是以研讨人员可以将T细胞的靶标与其RNA表达方法停止婚配。这使他们可以肯定哪些基因在靶向特定抗原的T细胞群体中具有活性。“要懂得T细胞的功效，就必需懂得它们的受体辨认的靶点信息。我们开辟的这种办法可以应用现有的单细胞RNA测序文库，并提取想要表征的相干序列。”研讨人员说，该技巧的另一个长处是它不须要昂贵的化学药品，它依附于很多试验室曾经拥有的装备，而且可以使用于很多先前处置过的样品。在文章中，研讨人员证实，在给小鼠接种了针对人乳头瘤病毒的疫苗后，可以应用该技巧遴选出对人乳头瘤病毒有活性的小鼠T细胞。他们发明，虽然一切这些T细胞都对病毒起反响，但这些细胞具有分歧的TCR，而且处于分歧的发育阶段：个中一些T细胞被激活以杀逝世被沾染的细胞，而另一些则专注于发展和决裂。然后，研讨人员剖析了四名对花生过敏患者的T细胞。将细胞裸露于花生过敏原后，他们可以判定出对那些过敏原具有活性的T细胞。他们还显示出T细胞的哪些亚群是最活泼的，并发明了一些正在发生平日与过敏反响有关的炎性细胞因子。“我们如今可以开端对数据停止分层，以提醒最主要的细胞是什么，而以前仅凭RNA测序无法辨认这些细胞。”（100医药网100yiyao.com）

资讯出处：

原始出处：Ang A. Tu, Todd M. Gierahn, Brinda Monian, Duncan M. Morgan, Naveen K. Mehta, Bert Ruiter, Wayne G. Shreffler, Alex K. Shalek, J. Christopher Love. Nature Immunology, 2019; 20 (12): 1692 DOI: 10.1038/s41590-019-0544-5