研讨提醒RNA poly(A)尾巴外部普遍存在其他碱基润饰

RNA poly(A)尾巴是成熟的mRNA和lncRNA的主要构成部门，对RNA波动性和翻译起侧重要的调控感化。但是今朝的poly(A)尾巴检测技巧依然十分无限。11月22日，中国迷信院与发育生物学研讨所陆发隆研讨组在《天然-通信》（Nature Communications）揭橥题为Poly(A) inclusive RNA isoform sequencing (PAIso-seq) reveals wide-spread non-adenosine residues within RNA poly(A) tails 的文章，树立了一种称为PAIso-seq的高敏锐度高精确度的RNA poly(A)尾巴检测技巧。经过PAIso-seq发明转录组中存在数kb长的poly(A)尾巴。全长RNA信息让研讨人员可以去摸索RNA可变剪切与poly(A)尾巴这两种主要RNA转录后调控之间的联系关系。PAIso-seq具有极高的敏锐度，可以在单个卵细胞中完成转录组程度的poly(A)尾巴的检测，为罕见微量样本的全转录组poly(A)尾巴剖析供给了技巧根底。包括poly(A)尾巴信息的全长转录本数据为研讨者懂得分歧RNA转录后调控的协同感化与机制供给了主要的对象。更有意思的是经过PAIso-seq发明poly(A)尾巴并不只是人们之前以为的一段纯A序列，也不只仅在3’末尾存在其他碱基润饰(U， G，C)。该研讨提醒了在小鼠GV期卵中有超越17%的mRNA poly(A)尾巴的主体区域存在普遍的U、G和C碱基的掺入。该发明将改写教科书中关于RNA poly(A)尾巴构成的描绘。近期在拟南芥、线虫和人细胞系中也发明了poly(A)尾巴的主体中含有非A碱基，个中在线虫和人细胞系研讨中开辟的FLAM-seq办法与PAIso-seq办法都是基于PacBio三代测序平台。相较FLAM-seq而言，PAIso-seq在敏锐度上有十分年夜的优势。这些新发明的poly(A)尾巴外部的非A碱基若何生成，对RNA起着什么样的调控感化是接上去要答复的主要成绩，该发明以及PAIso-seq办法为RNA转录后调控研讨翻开了一扇全新的年夜门。(100yiyao.com）