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科学家如何利用“大数据”助力人类疾病研究?

近年来,科学家们依托“”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,分享给大家!

图片来源:CC0 Public Domain

【1】

doi:10.3389/fimmu.2019.02616

每年,成千上万的美国人因流感而生病,成千上万的人住院或死亡。注射可以减少感染的机会。但是,根据疾病预防控制中心的说法,这种疫苗充其量只能在40%到60%的时间内有效。近日,来自密歇根州立大学的研究人员拥有的数据表明,感染或接种疫苗后细胞RNA水平如何变化。他们的工作可以帮助使未来的更好地发挥作用,甚至有助于通用疫苗的设计。

研究者表示,了解这些差异可能有助于我们确定构建更好的疫苗的新目标,并帮助我们找到更好的方法来治疗这种疾病。研究人员分析了先前发表的18项研究的数据,其中科学家从流感患者和疫苗接种者那里采集了血液样本,并对这些样本的基因表达进行了研究,合并不同数据的动机是通常较小的数据在统计上将不足以检测重大差异。

【2】

doi:10.1016/j.jacc.2019.07.022

美国科罗拉多大学博尔德分校(University of Colorado Boulder)对近50万人进行的一项最新研究显示,即使你不吸烟,经常锻炼,也没有心血管疾病的遗传易感,睡眠不足或睡眠过多也会增加你患心脏病的风险,这项研究发表在Journal of The American College of Cardiology杂志上,研究还发现,对于那些有高心脏病风险的人来说,每晚睡6至9小时可以抵消这种风险。

研究者表示,这提供了一些最有力的证据,证明睡眠时间是影响心脏健康的关键因素,这对每个人都适用,研究人员分析了46.1万名年龄在40岁至69岁之间、从未心脏病发作的英国生物银行(Biobank)参与者的基因信息、自我报告的睡眠习惯和医疗记录,然后对他们进行了7年的跟踪调查。与每晚睡眠6至9小时的人相比,睡眠不足6小时的人在研究期间心脏病发作的几率要高出20%。那些睡眠时间超过9小时的人有34%的可能性。

【3】扩散的分子机制

doi:10.1038/s41467-019-10148-6

如今科学家们能够利用大量基因组数据来及早发现患者的疾病状况,但同时这也能帮助研究人员更好地研究疾病发生的分子机制。近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自密歇根州立大学的科学家们通过进行分析,确定了一种更好的模型来对抗乳腺癌的扩散并能帮助测试有潜力的药物。实验室当前所使用的方法通常会利用细胞系或在平板上培养细胞,来模拟患者机体中的生长;扩散是最常见的癌症相关死亡的原因,大约与90%的癌症患者死亡直接相关,截至目前,很少有药物能够治疗患者的癌症转移,而且研究人员也并不清楚在药物开发的过程中到底哪个环节出错了。

研究者Bin Chen说道,细胞系和肿瘤样本之间的差异或许就提出了很多关键的问题,比如细胞系能在多大程度上捕获的构成;为了回答这个问题,研究人员对来自多个基因组数据库中的数据进行了大型整合分析,这些数据库包括人类癌症基因组图谱计划、癌症细胞系百科全书、基因表达综合和基因型及表型数据库等。利用这些基因组数据发现新型癌症疗法是研究人员最终的目标,在研究人员将大量成本投入到实验之前,我们就需要评估早期的研究模型,并基于基因组特征选择最合适的药物检测手段。

【4】的风险

doi:10.1001/jamainternmed.2019.2195

近日,一项刊登在国际杂志JAMA Internal Medicine上的研究报告中,来自哈佛大学陈曾熙公共卫生学院的研究人员通过进行一项新荟萃分析发现,坚持以植物为主的饮食的人比没有坚持以植物为主的饮食的人患2型的风险更低。研究人员还发现,对于那些饮食强调健康植物性食物的人来说,这种联系更强。

植物性饮食模式近年来越来越流行,所以我们认为量化它们与风险之间的整体联系是至关重要的,尤其是这些饮食差异显着的食品成分,虽然之前的研究表明,植物性饮食模式可能有助于降低2型的风险,但缺乏对流行病学证据进行整体分析的研究。据研究人员称,目前的研究为坚持健康的植物性饮食和降低2型糖尿病风险之间的关系提供了迄今为止最全面的证据。

【5】

doi:10.1038/s41588-019-0358-2

来自超过94,000名个体的遗传数据分析显示,阿尔茨海默病有五个新的风险基因,并确认了其他已知的20个基因。这些新发现支持开发证据,证明与特定生物过程相关的基因组,如细胞运输,脂质转运,炎症和免疫反应,是“中心”,是疾病过程的重要组成部分,该研究发表在Nature Genetics期刊上。

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