评估2019年新型冠状病毒(2019 |
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2002-2003年SARS、2012-2015年MERS以及2019-2020年武汉呼吸综合征的暴发清楚表明,动物冠状病毒(CoV)的基因组进化可能使其获得人类传播能力,从而对全球公共健康造成严重威胁。人们普遍认为,冠状病毒的人类传播是由其突刺蛋白(S蛋白)与宿主细胞表面上的人类受体的相互作用引起的。因此,对这些相互作用的定量评估可用于评估CoV的人类传播能力。但是,目前仍然缺乏直接使用病毒基因组数据的定量方法。复旦大学等机构的研究人员基于实验得到的SARS-CoV S-RBD-ACE2复杂结构,进行了大规模蛋白-蛋白对接,从而量化了2019-nCoV S-蛋白受体结合域(S-RBD)与人受体ACE2的相互作用。通过使用蒙特卡洛算法对大量热力学上可能的结合构象进行采样,该方法成功地将实验来源的复合物结构鉴定为最低能量的受体结合构象,从而建立了基于实验的强度参考,可用于评估与SARS-CoV相比之下2019-nCoV受体的结合亲和力。结果表明,这种结合亲和力约为SARS-CoV的73%,这表明2019-nCoV可能导致与SARS-CoV相似的人类传播。因此,这项研究提出了一种快速评估新出现CoV及其突变株人类传播能力的方法,并证明了蛋白质-蛋白质相互作用的后基因组分析可为病毒的预防和控制提供早期科学指导。( 100yiyao.com)
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