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新型冠状病毒2019

2020年3月22日讯/BIOON/---自2019年12月8日以来,中国湖北省武汉市报告了几例病因不明的肺炎。大多数患者在当地的华南海鲜批发市场工作或附近居住。在这种肺炎的早期阶段,严重的急性呼吸道感染症状出现了,一些患者迅速发展为急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)、急性呼吸衰竭和其他的严重并发症。2020年1月7日,中国疾病预防控制中心(China CDC)从患者的咽拭子样本中鉴定出一种新型冠状病毒,最初被世界卫生组织(WHO)命名为2019-nCoV。大多数2019-nCoV肺炎患者的症状较轻,预后良好。到目前为止,一些患者已经出现严重的肺炎,肺水肿,ARDS或多器官功能衰竭和死亡。

2019年新型冠状病毒(2019-nCoV),图片来自Wikipedia。 2020年2月11日,世卫组织将这种疾病病重命名为2019年冠状病毒病(COVID-19)。同一天,负责分类和命名病毒的的国际病毒分类学委员会的冠状病毒研究小组在bioRxiv上发表了一篇文章,指出该研究小组已经决定,新型冠状病毒2019-nCoV是导致2002-2003年爆发严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)的变种。因此,将这种新病原体重新命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2号(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2),或SARS-CoV-2。值得注意的一点是,尽管国际病毒分类委员会冠状病毒研究小组将病毒命名为SARS-CoV-2,但该研究小组主席John Ziebuhr认为这个名字(SARS-CoV-2)和SARS(严重急性呼吸综合征,也称非典型肺炎)没有关联。不过,这种病毒的重新命名引起了不少争议。据《科学》网站报道,世界卫生组织不满意SARS-CoV-2这个名字,而且不打算采用此名称。

冠状病毒可引起多种动物的多系统感染。在此之前已有6种冠状病毒可以感染人类,它们主要引起人类的呼吸道感染:两种高度致命性的冠状病毒,即严重急性呼吸道综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒(MERS-CoV);4种可导致温和的上呼吸道疾病的冠状病毒,即HCoV-OC43、HCoV-229E、HCoV-NL63和HCoV-HKU1。

基于此次疫情给中国和全世界带来严重的危害,小编针对近期2019-nCoV/COVID-19研究取得的进展进行一番梳理,以飨读者。

1.

doi:10.1038/d41573-020-00016-0

鉴于2019-nCoV疫情的紧迫性,中国中南大学湘雅公共卫生学院的李广迪(Guangdi Li)博士和比利时天主教鲁汶大学雷加医学研究所的Erik De Clercq博士根据对另外两种由人类冠状病毒引起的感染---严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒(MERS-CoV)---的治疗经验,着重关注重新利用已批准或正在开发的用于治疗HIV、乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)和流感病毒引起的感染的抗病毒试剂的潜力。相关结果以评述文章(Comment)的形式于2020年2月10日发表在Nature Reviews Drug Discovery期刊上,文章标题“Therapeutic options for the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)”。

图1.乙型冠状病毒的潜在药物靶点,图片来自Nature Reviews Drug Discovery, 2020, doi:10.1038/d41573-020-00016-0。 考虑到对现有抗病毒药物的安全性的了解,以及它们在某些情况下对密切相关的冠状病毒的有效性,对它们进行重新利用可能是应对2019-nCoV的一个重要的近期策略。

针对瑞德西韦的III期已经启动,并且许多其他试验也在中国正在开展,以测试各种治疗选择,比如盐酸阿比朵尔(umifenovir)、奥司他韦(oseltamivir)和ASC09F(表1)。此外,50多种现有的MERS-CoV和/或SARS-CoV抑制剂,比如加利地韦、蛋白酶抑制剂GC813和化合物3k、解旋酶抑制剂SSYA10-001和核苷类似物吡唑呋喃菌素(pyrazofurin)(表1),可通过具有适当生物遏制能力的设施筛选它们的抗2019-nCoV活性。然而,已报道的现有MERS-CoV和/或SARS-CoV抑制剂的EC50和IC50值大多在微摩尔范围内,在准备进行临床评估之前很可能需要进一步优化它们的抗2019-nCoV活性。

2.

doi:10.1016/S0140-6736(20)30304-4

BenevolentAI的知识图谱是一个庞大的结构化医学信息库,包括通过机器学习从科学文献中提取出的众多关联性。针对2019-nCoV,来自英国BenevolentAI公司的研究人员使用BenevolentAI搜索可能有用的已批准药物,重点关注那些可能阻止这种病毒感染过程的药物。他们鉴定出巴瑞替尼(baricitinib),并预测它可降低这种病毒感染肺细胞的能力。相关研究结果以通讯文章(Correspondence)的形式于2020年2月4日在线发表在Lancet期刊上,论文标题为“Baricitinib as potential treatment for 2019-nCoV acute respiratory disease”。

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