迷信家若何应用机械进修手腕协助改良人类安康研讨？

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doi：10.1101/2020.05.06.081695

耶鲁年夜学医学院的迷信家们正在应用单细胞RNA测序来研讨SARS-CoV-2若何与宿主细胞互相感化。血汗管医学和盘算机迷信部医学助理传授David van Dijk博士和试验室医学和免疫生物学助理传授Craig Wilen博士应用被沾染的人类支气管上皮细胞(HBECs)的单细胞RNA序列数据来肯定病毒若何沾染和改动安康细胞。

在bioRxiv预印本办事器上揭橥的这项研讨中，作者肯定了纤毛细胞是SARS-CoV-2沾染的次要目的。支气管上皮是对立过敏原和病原体的维护性樊篱。纤毛肃清呼吸道的粘液和其他颗粒。他们的发明为病毒若何激发疾病供给了深化的懂得。Wilen和博士后同事Mia Alfajaro博士在空气-液体界面中使HBECs沾染了SARS-CoV-2。在三天的工夫里，他们应用单细胞RNA测序来辨认沾染静态的特点，例如分歧细胞类型的沾染细胞数目，以及SARS-CoV-2能否激活了沾染细胞的免疫反响。专门研讨单细胞技巧的Van Dijk应用先辈的算法来开辟任务假定。

图片起源：sciencealert.com

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doi：10.1371/journal.pone.0232391

日前，一篇揭橥在国际杂志PLoS ONE上的研讨申报中，来自西安年夜略年夜学等机构的迷信家们经过研讨应用机械进修技巧辨认出了29种分歧COVID-19 DNA序列的潜在基因组特征。这种新型的数据发明对象可以协助研讨人员疾速且轻易地在几分钟内对诸如SARS-CoV-2等致逝世性病毒停止分类。

这项研讨支撑了研讨者提出的假定，即SARS-CoV-2或许来源于蝙蝠的Sarbecovirus亚属，其是Betacoronavirus属病毒的亚群，研讨者表现，这种超疾速、可扩大且具有高度精确性的分类细胞能应用一种基于图形的特别和决议计划树手腕来停止分类，并能在一切能够性的成果中挑选出最佳选择，全部办法应用了一种基于图形的专门来说明一切检测的能够性成果中的最佳成果。

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doi：10.1038/s41586-020-2140-0

日前，一项登载在国际杂志Nature上的研讨申报中，来自斯坦福年夜学等机构的迷信家们经过研讨或无望应用机械进修手腕来检测人类患者机体中的晚期肺癌，文章中，研讨人员剖析并检测了这种机械进修零碎，以及其寻觅血液样本中的轮回DNA（ctDNA）的才能。肺癌是一种最罕见的致逝世性癌症，与好多癌症一样，肺癌发明得越早，患者的生活机遇就越年夜；但很不幸的是，今朝研讨人员仅能经过CT扫描来对肺癌停止诊断，这种检测手腕不只昂贵并且假阳性率较高，基于这一缘由，研讨人员不断想经过研讨开辟出能在晚期阶段对肺癌停止的血液检测手腕。

新型的血液检测手腕将会触及对血液样本中的ctDNA停止筛查，随后研讨者开端转向开辟机械进修零碎，此前研讨成果标明，应用机械进修技巧无望辨认出晚期乳腺癌和其它类型的癌症。这项研讨中，研讨人员练习机械进修模子，使其可以辨认出与非小细胞肺癌相干的数据参数，一旦该机械模子停止了练习，其就能对既定患者的肺癌风险停止无效评价。

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doi：10.1126/scitranslmed.aax7533

在一项新的研讨中，来自中国中山年夜学防治中间等机构研讨人员应用了一种针对癌症甲基化特点的机械进修算法来诊断结直肠癌。相干研讨成果揭橥在Science Translational Medicine期刊上；在这篇论文中，他们描绘了他们和猜测结直肠癌的新办法以及它的后果若何。

以后，检测结直肠癌的金尺度是结肠镜反省---不幸的是，这种办法是侵入式的，这会让患者觉得不舒畅和为难。鉴于此，很多人保持了测试，可悲的是，个中的一些人患上了却直肠癌，但长工夫未被发明。回绝检测是有成绩的，这是由于结直肠癌是全球第三年夜致命癌症。迷信家们认识到了这个成绩，并持续寻觅其他办法来检测这种疾病。一个有远景的研讨范畴触及在血液中寻觅这种疾病的标记物，这种办法的侵入性要小得多。不幸的是，如许的测试依然不如结肠镜反省无效。在这项新的研讨中，这些研讨人员研讨了组合应用两种对象来进步精确性的能够性。

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doi：10.1016/j.celrep.2018.03.046

近日，一项登载在国际杂志Cell Reports上的研讨申报中，来自宾夕法尼亚年夜学的研讨人员经过研讨表现，作为新兴的精准医疗研讨范畴，未来自癌症患者的特别信息与疗法选择停止无效婚配或许无法无效辨别出一切对特别疗法可以发生反响的患者，而来自患者的其它分子信息或许就可以提醒这些所谓的“隐蔽反响者”。