全球微生物形式基因组测序筹划获得主要停顿

10月29日，《核酸研讨》（Nucleic AcidsResearch）在线揭橥了国度微生物迷信数据中间（中国迷信院微生物研讨所微生物质源与中间、世界微生物数据中间）团队关于全球形式微生物基因组数据库gcType的文章。gcType是由我国牵头的全球形式微生物基因组测序筹划的主要结果。

形式菌株（type strains）是在给微生物命名、分类记录和揭橥时，以纯菌形态所保管的菌种，是微生物分类学的尺度参考物资，也是幻想的生物技巧研讨对象，具有主要的科研和家当价值。形式菌株历久以来疏散在全球列国超越100余个保藏中间，是各个保藏中间甚为名贵的资本。2018年，微生物所牵头组织提议了全球形式微生物基因组测序筹划，从全球微生物质源保藏中间选择今朝未停止测序的形式微生物菌株（包含细菌、古菌和可培育真菌），估计5年内完成超越10，000种的、真菌、古菌形式菌株基因组测序，树立全球微生物形式菌株基因组测序协作收集，现已有来自美国的ATCC、日本JCM和NBRC、韩国的KCTC等超越12个国度的26个微生物质源保藏中间正式参加该筹划并构成了主要了阶段性结果。

今朝，国度微生物数据中间（世界微生物数据中间）曾经构成了国际引领的微生物平台系统。个中全球微生物菌种目次（Global Catalogueof Microorganism， gcm）集成了来自全球50个国度133个微生物质源中间46万微生物菌种资本数据(Nucleic Acids Res. 2016)，是今朝最年夜的微生物什物资本数据平台。全球形式微生物基因组数据库（Global Catalogueof Type Strain， gcType）整合了16701个无效揭橥的原核生物的超越13 944个基因组数据(Nucleic Acids Res.2020)，是今朝在形式微生物基因组方面数据最为片面，功效最为完美的数据平台，为用户供给一站式的数据治理和基因组正文、新种判定等剖析。全球微生物组数据库（The GlobalCatalogue of Metagenomics， gcMeta）整合了超越200TB宏基因组相干数据和超越100个在线数据剖析对象及整合的任务流(Nucleic Acids Res. 2019)。

国度微生物迷信数据中间继续为超越90个国度的用户供给高质量的数据办事，努力于树立国际一流的微生物数据中间。国度微生物迷信数据中间史文聿博士和孙清岚博士为文章配合第一作者，中间马俊才研讨员与吴林寰研讨员为配合通信作者，国际外22个团队配合介入了文章的相干任务。衷心感激中国迷信院国际年夜迷信培养专项筹划、科技部国度微生物迷信数据中间、中国迷信院微生物学科数据中间、中国迷信院地球A类先导专项、中国迷信院计谋生物质源收集筹划等项目标历久支撑。